Это приложение для Linux под названием ProGraphMSA, последний выпуск которого можно загрузить как ProGraphMSA-20130709.tar.gz. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием ProGraphMSA с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
ПроГрафМСА
Ad
ОПИСАНИЕ
ProGraphMSA - это современный инструмент для совмещения множественных последовательностей, который создает филогенетически разумные паттерны разрывов, сохраняя при этом надежность, допуская альтернативные сращивания и ошибки в паттерне ветвления направляющего дерева. Это достигается за счет включения представления последовательности на основе графов, как в POA, и объединения его с преимуществами алгоритма, учитывающего филогенез, в Prank. Кроме того, мы учитываем вариации в паттерне замен, используя оценочные частоты аминокислот и реализуя профили, зависящие от контекста, как в CS-Blast.Последние версии ProGraphMSA включают и расширяют модель выравнивания для поддержки вставок и удалений тандемных повторяющихся единиц.
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/prographmsa/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
