Это приложение для Linux под названием RNASeq-MATS, последнюю версию которого можно загрузить как rmats2sashimiplot_test_data.tar.gz. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием RNASeq-MATS с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
СКРИНШОТЫ
Ad
RNASeq-MATS
ОПИСАНИЕ
MATS - это вычислительный инструмент для обнаружения дифференциальных альтернативных событий сплайсинга на основе данных RNA-Seq. Статистическая модель MATS вычисляет P-значение и частоту ложного обнаружения того, что разница в соотношении изоформ гена между двумя состояниями превышает заданный пользователем порог. На основе данных RNA-Seq MATS может автоматически обнаруживать и анализировать альтернативные события сплайсинга, соответствующие всем основным типам альтернативных шаблонов сплайсинга. MATS обрабатывает реплицируемые данные RNA-Seq как для парных, так и для непарных исследований. Более подробную информацию можно найти на сайте http://rnaseq-mats.sourceforge.net.
Категории
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/rnaseq-mats/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
