Это приложение для Linux под названием SASHIMI, последнюю версию которого можно загрузить как TPP_Setup_6.3.3.exe. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием SASHIMI с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
СКРИНШОТЫ
Ad
САШИМИ
ОПИСАНИЕ
В проекте Sashimi размещен Trans-Proteomic Pipeline (TPP), зрелый набор инструментов для протеомики на основе масс-спектрометрии (МС, МС/МС): статистическая проверка, количественный анализ, визуализация и преобразование необработанных данных МС в открытый mzML/ форматы mzXML.
Особенности
- Поисковые системы баз данных (comet и т. д.)
- SpecraST (Поисковая система библиотеки спектров)
- Открытый массовый поиск (Магнум и др.)
- Kojak (поиск перекрестных ссылок)
- ДДА-анализ
- DISCo (Анализ DIA)
- reSpect (анализ химерного спектра)
- MS1 и MS2 Количественное определение меченых и немеченых
- Генерация базы данных приманок
- PeptideProphet (проверка уровня PSM)
- iProphet (проверка уровня пептидов)
- PTMProphet (валидация посттрансляционной модификации)
- Проверка уровня белка
- Генерация библиотеки спектров
- Инструменты визуализации данных
- Каталогизация и прогнозирование времени удерживания
Аудитория
Наука / Исследования
Интерфейс пользователя
Веб-интерфейс, командная строка
Язык программирования
Python, Perl, C++, C, JavaScript, Java
Категории
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/sashimi/. Он был размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
