Это приложение для Linux под названием SecStAnT, последнюю версию которого можно загрузить как SecStAnT.jar. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием SecStAnT с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
СКРИНШОТЫ
Ad
СЕКСТАН
ОПИСАНИЕ
SecStAnT - это инструмент для автоматического создания наборов данных структур из Protein Data Bank (PDB) с определяемым пользователем структурным составом и для расчета распределений их внутренних переменных.
SecStAnT может
1. Выберите из наборов данных PDB структур на основе заданных пользователем вторичных структур (определенных на основе внутренней классификации PDB или DSSP) и / или мотивов последовательности.
2. Создавайте наборы данных с разными уровнями разрешения (все атомы, только магистраль, только Cα, ...)
3. Оцените статистические распределения внутренних переменных:
а. распределения с одной переменной (включая наиболее релевантные в атомистическом представлении, например, PHI и PSI, а также ряд распределений для представления на основе Cα)
б. корреляции двух переменных (включая карту Рамачандрана PHI-PSI и ее эквивалент в представлении на основе Cα)
c. корреляции трех переменных
Интерфейс пользователя
Java-свинг
Язык программирования
Java
Категории
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/secstant/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
