Это приложение для Linux под названием SeqSelector для запуска в Linux в Интернете, последний выпуск которого можно загрузить как SeqSelector1.1b.zip. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием SeqSelector, чтобы работать в Linux онлайн с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
SeqSelector для запуска в Linux онлайн
ОПИСАНИЕ:
Набор инструментов SeqSelector представляет собой набор удобных для пользователя, платформенно-независимых скриптов Python для облегчения выбора последовательностей для целевого обогащения библиотек следующего поколения с помощью захвата последовательностей на основе гибридизации. Скрипты не требуют знания программирования и могут применяться к последовательностям генома модельных или немодельных видов. Мы предлагаем рабочий процесс, в котором интересующие гены сначала идентифицируются на основе предыдущих исследований и общедоступных наборов данных с функциональной аннотацией генов. После того, как список генов-кандидатов был идентифицирован, их последовательности выбираются из эталонного генома. Эти последовательности используются в качестве запроса во время поиска BLAST неаннотированного генома немодельного вида, а затем возвращаются соответствующие последовательности, которые можно использовать для создания приманок для захвата последовательностей на основе гибридизации.Язык программирования
Питон
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/seqselector/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.