Это приложение для Linux под названием TomoJ, последний выпуск которого можно загрузить как TomoJ_Applications-2.8.1-jar-with-dependencies.jar. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием TomoJ с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите онлайн-эмулятор OnWorks Linux или Windows или онлайн-эмулятор MACOS с этого веб-сайта.
- 5. В только что запущенной ОС OnWorks Linux перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение, установите его и запустите.
ТомоДж
Ad
ОПИСАНИЕ
TomoJ - это плагин ImageJ для томографической реконструкции.
Он был разработан для электронной томографии, однако любое сканирование с параллельным лучом должно работать.
TomoJ предлагает предварительную обработку и регистрацию серий наклона перед 3D реконструкциями (WBP, ART, SIRT, OS-SART, сжатое зондирование).
TomoJ написан на Java, вычисления являются многопоточными, а реконструкция может выполняться на CPU или GPU (OpenCL).
регистрация описана в:
Journal of Structural Biology: X.2020, Volume 4. «Улучшения безмаркерного выравнивания изображений для электронной томографии» COS Sorzano et al. https://doi.org/10.1016/j.yjsbx.2020.100037.
BMC Bioinformatics. 2009, 27 апреля; 10: 124. «Безмаркерная регистрация изображений серии наклона электронной томографии». COS Sorzano et al.
Реконструкция описана в:
BMC Bioinformatics. 2007 августа 6 г .; 8: 288. «TomoJ: программное обеспечение для томографии для трехмерной реконструкции в просвечивающей электронной микроскопии». Messaoudi C et al.
Особенности
- томография
- ИзображениеJ
- Выравнивание серии наклона
- 3D реконструкция
- ФСФ
- ART
- СИРТ
- сжатое зондирование
Интерфейс пользователя
Java-свинг
Язык программирования
Ява, OpenCL
Категории
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/tomoj/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
