Это приложение для Windows под названием AutoDockParser, последнюю версию которого можно загрузить как AutodockParser.exe. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и бесплатно запустите онлайн это приложение под названием AutoDockParser с помощью OnWorks.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите любой онлайн-эмулятор OS OnWorks с этого сайта, но лучше онлайн-эмулятор Windows.
- 5. В только что запущенной ОС Windows OnWorks перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение и установите его.
- 7. Загрузите Wine из репозиториев программного обеспечения вашего дистрибутива Linux. После установки вы можете дважды щелкнуть приложение, чтобы запустить его с помощью Wine. Вы также можете попробовать PlayOnLinux, необычный интерфейс поверх Wine, который поможет вам установить популярные программы и игры для Windows.
Wine - это способ запустить программное обеспечение Windows в Linux, но без Windows. Wine - это уровень совместимости с Windows с открытым исходным кодом, который может запускать программы Windows непосредственно на любом рабочем столе Linux. По сути, Wine пытается заново реализовать Windows с нуля, чтобы можно было запускать все эти Windows-приложения, фактически не нуждаясь в Windows.
АвтоДокПарсер
Ad
ОПИСАНИЕ
AutoDock Suit — одно из самых популярных программ для проведения молекулярной стыковки и виртуального скрининга. Этот костюм предлагает две программы AutoDock и AutoDock Vina. AutoDock предоставляет выходные данные в виде файлов журнала стыковки (файлы DLG), а последний выводит в формате pdbqt.
Постобработка этих результатов долгое время оставалась ручной работой, поэтому разрабатываются различные протоколы и рабочие процессы, ориентированные на конкретного пользователя. Ручная обработка этих результатов для последующего анализа взаимодействия остается трудоемкой и, по-видимому, обыденной задачей. Ручная обработка предполагает зависимость от различного внешнего программного обеспечения.
AutoDock Parser предлагает автоматическую постобработку результатов стыковки, полученных из AutoDock Suit. AutoDock Parser — удобный инструмент, призванный минимизировать усилия при постобработке результатов стыковки. Он позволяет пользователю создавать комплексы белок-лиганд из входных файлов DLG/PDBQT за один шаг.
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/autodockparser/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было проще запускать в Интернете из одной из наших бесплатных операционных систем.
