АнглийскийФранцузскийИспанский

Значок OnWorks

Скачать BBMap для Windows

Бесплатно скачайте приложение BBMap для Windows, чтобы запустить онлайн win Wine в Ubuntu онлайн, Fedora онлайн или Debian онлайн

Это приложение для Windows под названием BBMap, последний выпуск которого можно загрузить как BBMap_39.03.tar.gz. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.

Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием BBMap с OnWorks бесплатно.

Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:

- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.

- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.

- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.

- 4. Запустите любой онлайн-эмулятор OS OnWorks с этого сайта, но лучше онлайн-эмулятор Windows.

- 5. В только что запущенной ОС Windows OnWorks перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.

- 6. Скачайте приложение и установите его.

- 7. Загрузите Wine из репозиториев программного обеспечения вашего дистрибутива Linux. После установки вы можете дважды щелкнуть приложение, чтобы запустить его с помощью Wine. Вы также можете попробовать PlayOnLinux, необычный интерфейс поверх Wine, который поможет вам установить популярные программы и игры для Windows.

Wine - это способ запустить программное обеспечение Windows в Linux, но без Windows. Wine - это уровень совместимости с Windows с открытым исходным кодом, который может запускать программы Windows непосредственно на любом рабочем столе Linux. По сути, Wine пытается заново реализовать Windows с нуля, чтобы можно было запускать все эти Windows-приложения, фактически не нуждаясь в Windows.

СКРИНШОТЫ

Ad


BBMКарта


ОПИСАНИЕ

Этот пакет включает BBMap, выравниватель короткого чтения, а также различные другие биоинформатические инструменты. Он написан на чистой Java, может работать на любой платформе и не имеет никаких зависимостей, кроме установленной Java (скомпилирован для Java 6 и выше). Все инструменты производительные и многопоточные.

BBMap: выравниватель короткого чтения для данных ДНК и РНК-seq. Способен обрабатывать произвольно большие геномы с миллионами каркасов. Обрабатывает Illumina, PacBio, 454 и другие операции чтения; очень высокая чувствительность и толерантность к ошибкам и многочисленным крупным отступам. Очень быстро.

BBNorm: инструмент для исправления ошибок и нормализации на основе Kmer.

Dedupe: упрощает сборки, удаляя повторяющиеся или содержащиеся подпоследовательности, которые имеют целевую процентную идентичность.

Reformat: переформатирует чтение между fasta / fastq / scarf / fasta + qual / sam, interleaved / paired и ASCII-33/64 со скоростью более 500 МБ / с.

BBDuk: Фильтры, обрезки или маски читаются с совпадениями kmer в файл артефакта / загрязнителя.

... И многое другое!



Особенности

  • Чистая Java, работает на любой платформе; уже скомпилирован, просто разархивируйте и запустите.
  • Быстрый, эффективный и многопоточный.
  • Информация об использовании отображается при запуске сценария оболочки без параметров.
  • Самая высокая чувствительность среди всех элайнеров для коротких считываний.
  • Легко установить - просто разархивируйте / распакуйте.
  • Легко использовать. Пример: bbmap.sh ref = ecoli.fa in = reads.fq out = mapped.sam
  • Обрабатывает все распространенные форматы: fasta, fastq, sam, scarf, fasta + qual, ASCII-33, ASCII-64, gzip.
  • Используется Объединенным институтом генома.
  • BB означает Bestus Bioinformaticus.
  • Здесь есть удобный FAQ: http://seqanswers.com/forums/showthread.php?t=58221


Аудитория

Наука / Исследования


Интерфейс пользователя

Консоль / Терминал


Язык программирования

Java


Категории

Биоинформатика, Медицина

Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/bbmap/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.


Бесплатные серверы и рабочие станции

Скачать приложения для Windows и Linux

  • 1
    VBA-M (Архивировано - сейчас на Github)
    VBA-M (Архивировано - сейчас на Github)
    Проект переехал в
    https://github.com/visualboyadvance-m/visualboyadvance-m
    Особенности:Создание читовСохранить состояниямульти
    система, поддерживает gba, gbc, gb, sgb,
    sgb2Т...
    Скачать VBA-M (в архиве — сейчас на Github)
  • 2
    Stacer
    Stacer
    Оптимизатор системы Linux и мониторинг
    Репозиторий Github:
    https://github.com/oguzhaninan/Stacer.
    Аудитория: конечные пользователи / рабочий стол. Пользователь
    интерфейс: Qt. Программирование Ла...
    Скачать Стасер
  • 3
    ОранжевыйФокс
    ОранжевыйФокс
    Форк TeamWinRecoveryProject (TWRP)
    с множеством дополнительных функций, редизайн
    и другие особенности: поддерживает высокие частоты и
    не-Treble ROMsОбновленное ядро ​​​​Oreo,
    построен ...
    Скачать OrangeFox
  • 4
    itop — ITSM CMDB с открытым исходным кодом
    itop - ITSM CMDB с открытым исходным кодом
    Портал ИТ-операций: полностью открытый
    источник, ITIL, веб-сервис
    инструмент управления, включающий полностью
    настраиваемая CMDB, система службы поддержки и
    документальный человек...
    Скачать itop - ITSM CMDB OpenSource
  • 5
    Клементин
    Клементин
    Clementine — это мультиплатформенная музыка.
    проигрыватель и организатор библиотеки, вдохновленный
    Амарок 1.4. Обладает быстрым и
    удобный интерфейс и позволяет
    поиск и...
    Скачать Клементину
  • 6
    XISmuS
    XISmuS
    ВНИМАНИЕ: В накопительном обновлении 2.4.3 есть
    был выпущен !! Обновление работает для любых
    предыдущая версия 2.xx. Если обновление
    начиная с версии v1.xx, скачайте и
    Я ...
    Скачать XISmuS
  • Больше »

Команды Linux

Ad