Это приложение для Windows под названием Calis-p, последнюю версию которого можно загрузить как Calisp-2.1.zip. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием Calis-p с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите любой онлайн-эмулятор OS OnWorks с этого сайта, но лучше онлайн-эмулятор Windows.
- 5. В только что запущенной ОС Windows OnWorks перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение и установите его.
- 7. Загрузите Wine из репозиториев программного обеспечения вашего дистрибутива Linux. После установки вы можете дважды щелкнуть приложение, чтобы запустить его с помощью Wine. Вы также можете попробовать PlayOnLinux, необычный интерфейс поверх Wine, который поможет вам установить популярные программы и игры для Windows.
Wine - это способ запустить программное обеспечение Windows в Linux, но без Windows. Wine - это уровень совместимости с Windows с открытым исходным кодом, который может запускать программы Windows непосредственно на любом рабочем столе Linux. По сути, Wine пытается заново реализовать Windows с нуля, чтобы можно было запускать все эти Windows-приложения, фактически не нуждаясь в Windows.
СКРИНШОТЫ:
Калис-п
ОПИСАНИЕ:
Calis-p (подход CALgary к изотопам в протеомике) представляет собой Java-приложение для оценки изотопного состава (например, дельта13C или дельта15N) отдельных видов в микробном сообществе из набора протеомных данных. Calis-p 2.0 обрабатывает как естественное содержание изотопов, так и данные экспериментов по маркировке, таких как зондирование стабильных изотопов (SIP). Для этого требуется mzIdent (или совпадение целевого спектра) и файлы mzML в качестве входных данных, и требуется около 1 минуты на файл mzML с 10 потоками и требуется <10 ГБ ОЗУ. Он был протестирован с использованием данных различных платформ наножидкостной хроматографии/Orbitrap. Для успешного SIP он чрезвычайно чувствителен, но требует, чтобы фракция 13C оставалась ниже 10%.
Это программное обеспечение больше не поддерживается. Вместо этого используйте более новую версию Python: https://github.com/kinestetika/Calisp
Особенности
- delta13C оценивается по стандартному набору метапротеомных данных.
- Эффективно и надежно получать дельта13C для многих видов в образцах микробиома.
Категории
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/calis-p/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.