Это приложение для Windows под названием CRUMp, последнюю версию которого можно загрузить как crump-0.2.0.tar.gz. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием CRUMP с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите любой онлайн-эмулятор OS OnWorks с этого сайта, но лучше онлайн-эмулятор Windows.
- 5. В только что запущенной ОС Windows OnWorks перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение и установите его.
- 7. Загрузите Wine из репозиториев программного обеспечения вашего дистрибутива Linux. После установки вы можете дважды щелкнуть приложение, чтобы запустить его с помощью Wine. Вы также можете попробовать PlayOnLinux, необычный интерфейс поверх Wine, который поможет вам установить популярные программы и игры для Windows.
Wine - это способ запустить программное обеспечение Windows в Linux, но без Windows. Wine - это уровень совместимости с Windows с открытым исходным кодом, который может запускать программы Windows непосредственно на любом рабочем столе Linux. По сути, Wine пытается заново реализовать Windows с нуля, чтобы можно было запускать все эти Windows-приложения, фактически не нуждаясь в Windows.
CRUMP
Ad
ОПИСАНИЕ
CRUMp основан на методе обучения на основе ядра, который называется машиной для определения релевантности классификации (CRUM). Учитывая входной набор белковых последовательностей в формате FASTA, система выводит положение, тип остатка (S, T или Y) и предполагаемую вероятность фосфорилирования каждого тестируемого сайта.
Последние загружаемые файлы:
- crump-0.2.0.tar.gz: пакет CRUMp GNU Octave
- crump-0.2.0.zip: CRUMp MATLAB скрипт
- crumptestset.fasta: набор данных тестирования в формате FASTA. Заголовки последовательностей содержат номер доступа последовательности белка и номера позиций известных сайтов фосфорилирования. Обратите внимание, что CRUMp может предсказывать дополнительные сайты фосфорилирования, которые еще не были экспериментально подтверждены.
Набор данных тестирования взят из Biswas et al. 2010, http://www.biomedcentral.com/1471-2105/11/273/additional.
Аудитория
Наука / Исследования
Язык программирования
MATLAB
Категории
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/crump/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в сети с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
