Это приложение для Windows под названием kallisto, последний выпуск которого можно загрузить как kallisto_windows-v0.50.0.zip. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием kallisto с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите любой онлайн-эмулятор OS OnWorks с этого сайта, но лучше онлайн-эмулятор Windows.
- 5. В только что запущенной ОС Windows OnWorks перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение и установите его.
- 7. Загрузите Wine из репозиториев программного обеспечения вашего дистрибутива Linux. После установки вы можете дважды щелкнуть приложение, чтобы запустить его с помощью Wine. Вы также можете попробовать PlayOnLinux, необычный интерфейс поверх Wine, который поможет вам установить популярные программы и игры для Windows.
Wine - это способ запустить программное обеспечение Windows в Linux, но без Windows. Wine - это уровень совместимости с Windows с открытым исходным кодом, который может запускать программы Windows непосредственно на любом рабочем столе Linux. По сути, Wine пытается заново реализовать Windows с нуля, чтобы можно было запускать все эти Windows-приложения, фактически не нуждаясь в Windows.
СКРИНШОТЫ:
Каллисто
ОПИСАНИЕ:
kallisto — это программа для почти оптимального количественного определения распространенности транскриптов на основе данных RNA-Seq или, в более общем смысле, целевых последовательностей с использованием высокопроизводительного считывания секвенирования. Он основан на идее использования псевдовыравнивания для быстрого определения совместимости чтений и целей без необходимости выравнивания.
Согласно эталонным тестам, проведенным на настольном компьютере Mac, kallisto может количественно оценить 30 миллионов считываний последовательностей РНК человека менее чем за 3 минуты, используя только последовательности считывания и индекс транскриптома, что само по себе может занять более 10 минут. А поскольку он использует псевдовыравнивание, он устойчив к ошибкам при чтении и сохраняет ключевую информацию, необходимую для количественного определения. Это делает kallisto не только быстрым, но и очень точным. Во многих тестах он даже значительно превосходит существующие инструменты.
Особенности
- Использует псевдовыравнивание
- Быстро и точно
- Количественную массовую РНК-Seq можно анализировать с помощью сыщика.
- Может использоваться с автобусными инструментами для предварительной обработки данных одноклеточной РНК-секвенции.
Язык программирования
C
Категории
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/kallisto.mirror/. Он был размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.