Это приложение для Windows под названием P3BSseq для запуска в Windows в Интернете поверх Linux в Интернете, последний выпуск которого можно загрузить как P3BSseq_v2.1.zip. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием P3BSseq для работы в Windows онлайн поверх Linux онлайн с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите любой онлайн-эмулятор OS OnWorks с этого сайта, но лучше онлайн-эмулятор Windows.
- 5. В только что запущенной ОС Windows OnWorks перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение и установите его.
- 7. Загрузите Wine из репозиториев программного обеспечения вашего дистрибутива Linux. После установки вы можете дважды щелкнуть приложение, чтобы запустить его с помощью Wine. Вы также можете попробовать PlayOnLinux, необычный интерфейс поверх Wine, который поможет вам установить популярные программы и игры для Windows.
Wine - это способ запустить программное обеспечение Windows в Linux, но без Windows. Wine - это уровень совместимости с Windows с открытым исходным кодом, который может запускать программы Windows непосредственно на любом рабочем столе Linux. По сути, Wine пытается заново реализовать Windows с нуля, чтобы можно было запускать все эти Windows-приложения, фактически не нуждаясь в Windows.
СКРИНШОТЫ
Ad
P3BSseq для работы в Windows онлайн поверх Linux онлайн
ОПИСАНИЕ
Обработка бисульфитного секвенирования (BSseq) является одним из самых громоздких приложений секвенирования следующего поколения (NGS). Хотя некоторые инструменты обработки BSseq доступны, они разрознены, требуют непонятных параметров и требуют времени работы и использования памяти. Мы разработали P3BSseq, конвейер параллельной обработки для быстрого, точного и автоматического анализа считываний BSseq, который обрезает, выравнивает, аннотирует, записывает промежуточные результаты, выполняет оценку качества бисульфитного преобразования, генерирует метилом BED и файлы отчетов в соответствии со стандартами NIH. P3BSseq превосходит известные преобразователи BSseq в отношении времени работы и требований к компьютерному оборудованию. Мы оптимизировали параметры P3BSseq как для направленных, так и для ненаправленных библиотек, а также для одностороннего и парного чтения целостного генома и сокращенного представления BSseq. P3BSseq - это удобное оптимизированное решение для восходящего анализа BSseq, требующее только базовых знаний компьютера и NGS.Особенности
- Обработка данных секвенирования следующего поколения (NGS)
- Метиломический анализ ДНК
- Параллельная обработка
- Сниженная репрезентативность бисульфитного секвенирования (RRBS)
Аудитория
Наука / Исследования
Интерфейс пользователя
Консоль / Терминал
Язык программирования
Питон
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/p3bsseq/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в сети с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.
