Это приложение для Windows с именем UniPyRange, последний выпуск которого можно загрузить как UniPyRangeSuite.py. Его можно запустить онлайн на бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием UniPyRange с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите любой онлайн-эмулятор OS OnWorks с этого сайта, но лучше онлайн-эмулятор Windows.
- 5. В только что запущенной ОС Windows OnWorks перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение и установите его.
- 7. Загрузите Wine из репозиториев программного обеспечения вашего дистрибутива Linux. После установки вы можете дважды щелкнуть приложение, чтобы запустить его с помощью Wine. Вы также можете попробовать PlayOnLinux, необычный интерфейс поверх Wine, который поможет вам установить популярные программы и игры для Windows.
Wine - это способ запустить программное обеспечение Windows в Linux, но без Windows. Wine - это уровень совместимости с Windows с открытым исходным кодом, который может запускать программы Windows непосредственно на любом рабочем столе Linux. По сути, Wine пытается заново реализовать Windows с нуля, чтобы можно было запускать все эти Windows-приложения, фактически не нуждаясь в Windows.
СКРИНШОТЫ:
UniPyRange
ОПИСАНИЕ:
Очень простой скрипт на Python, который избавит вас от необходимости подсчета аминокислот / оснований ДНК в файлах fasta из Uniprot и NCBI RefSeq Database (1, 2).
Допустим, вам нужна аминокислотная последовательность диапазона 128-387 из 1000 аминокислотного белка - этот сценарий поможет вам избежать ошибок подсчета, просто показывая вам указанную последовательность в аминокислотах и кодирующих пары оснований ДНК (идеально для разработки праймера для амплификации. ) указанного идентификатора Uniprot ID.
- Требуется BioPython (3) и пакет биосервисов (4)
(1)
Консорциум UniProt
UniProt: центр информации о белках
Нуклеиновые Кислоты Res. 43: Д204-Д212 (2015).
(2)
RefSeq: обновление референсных последовательностей млекопитающих. Nucleic Acids Res. 2014 1 января; 42 (1): D756-63.
(3)
Cock PJ et al. Биоинформатика (2009)
(4)
Кокелаер и др., Биоинформатика (2013 г.)
Язык программирования
Питон
Категории
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/unipyrange/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.