Это приложение для Windows под названием YeastpRofile для запуска в Windows в Интернете поверх Linux в Интернете, последний выпуск которого можно загрузить как YeastpRofile_V.2.zip. Его можно запустить онлайн в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks для рабочих станций.
Загрузите и запустите онлайн это приложение под названием YeastpRofile для работы в Windows онлайн поверх Linux онлайн с OnWorks бесплатно.
Следуйте этим инструкциям, чтобы запустить это приложение:
- 1. Загрузил это приложение на свой компьютер.
- 2. Введите в нашем файловом менеджере https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 3. Загрузите это приложение в такой файловый менеджер.
- 4. Запустите любой онлайн-эмулятор OS OnWorks с этого сайта, но лучше онлайн-эмулятор Windows.
- 5. В только что запущенной ОС Windows OnWorks перейдите в наш файловый менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX с желаемым именем пользователя.
- 6. Скачайте приложение и установите его.
- 7. Загрузите Wine из репозиториев программного обеспечения вашего дистрибутива Linux. После установки вы можете дважды щелкнуть приложение, чтобы запустить его с помощью Wine. Вы также можете попробовать PlayOnLinux, необычный интерфейс поверх Wine, который поможет вам установить популярные программы и игры для Windows.
Wine - это способ запустить программное обеспечение Windows в Linux, но без Windows. Wine - это уровень совместимости с Windows с открытым исходным кодом, который может запускать программы Windows непосредственно на любом рабочем столе Linux. По сути, Wine пытается заново реализовать Windows с нуля, чтобы можно было запускать все эти Windows-приложения, фактически не нуждаясь в Windows.
СКРИНШОТЫ:
YeastpRofile для запуска в Windows онлайн поверх Linux онлайн
ОПИСАНИЕ:
YeastpRofile - это портативное приложение Windows-формы, написанное на C #, для вычисления профиля геномной переменной вокруг сайтов начала транскрипции (TSS) и терминации (TTS) мРНК дрожжей. Профиль получается путем расчета коэффициента корреляции Пирсона (R) для всего генома между значениями геномных переменных и подсчетами TSS (или TTS) при постепенном смещении транскрибируемой цепи. Данные подсчета TSS и TTS, использованные для расчета профилей, были взяты из работы Pelechano et al. (1). Входной файл должен быть файлом в формате BedGraph, основанном на выпуске последовательности генома дрожжей R64. Выходной файл представляет собой текстовую таблицу с разделителями-табуляторами, содержащую значения R для различных сдвигов переменных координат относительно TSS или TTS. R, относящийся к каждой цепи, также сообщается для подтверждения того, что подобный профиль получается в двух направлениях транскрипции.1) В. Пелехано, В. Вей, Л. М. Стейнмец, Обширная транскрипционная гетерогенность, выявленная с помощью изоформного профилирования, Nature, 497 (2013) 127-13.
Аудитория
Наука / Исследования
Язык программирования
C#
Это приложение также можно загрузить с https://sourceforge.net/projects/yeastprofile/. Он размещен в OnWorks, чтобы его можно было легко запускать в Интернете с помощью одной из наших бесплатных операционных систем.