นี่คือคำสั่ง createChemistryHeader ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสติ้งฟรีของ OnWorks โดยใช้หนึ่งในเวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
createChemistryHeader.py - สร้างส่วนหัว SAM ด้วยเคมีจัดลำดับ PacBio
ข้อมูล
DESCRIPTION
การใช้งาน: getChemistryHeader.py [-h] [--debug] --bas_files BAS_FILES
[BAS_FILES ... ]
input_alignment_file output_header_file
createChemistryHeader สร้างส่วนหัว SAM ที่มีข้อมูลเคมีที่ใช้โดย
สั่น.
ตำแหน่ง ข้อโต้แย้ง:
input_alignment_file
ไฟล์ SAM หรือ BAM ที่สร้างโดย BLASR
output_header_file
ชื่อของไฟล์ส่วนหัว SAM หรือ BAM ที่จะสร้างด้วยข้อมูลเคมี
โหลด
ไม่จำเป็น ข้อโต้แย้ง:
-h, --ช่วยด้วย
แสดงข้อความช่วยเหลือนี้และออก
--debug
ส่งออกข้อมูลบันทึกโดยละเอียด (ค่าเริ่มต้น: เท็จ)
--bas_files BAS_FILES [BAS_FILES ... ]
ไฟล์ bas หรือ bax ที่มีการอ่านที่จัดตำแหน่งใน
input_alignment_file.jpg นอกจากนี้ยังสามารถเป็นไฟล์ fofn ของ bas หรือ bax (ค่าเริ่มต้น: ไม่มี)
ใช้ createChemistryHeader ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net
