นี่คือคำสั่ง fastq-clipper ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสติ้งฟรีของ OnWorks โดยใช้หนึ่งในเวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
fastq-clipper - ea-utils: ลบลำดับอะแดปเตอร์อย่างน้อยหนึ่งรายการออกจากไฟล์ fastq
DESCRIPTION
การใช้งาน: fastq-clipper [ตัวเลือก]
ลบลำดับอะแด็ปเตอร์ตั้งแต่หนึ่งลำดับขึ้นไปจากไฟล์ fastq ลำดับของอะแดปเตอร์คือ
คั่นด้วยเครื่องหมายทวิภาค สถิติไปที่ stderr เว้นแต่ -o ระบุไว้
OPTIONS
-h ความช่วยเหลือนี้
-o ไฟล์เอาต์พุต FIL (สถิติเป็น stdout)
-p N เปอร์เซ็นต์ความแตกต่างสูงสุด (10)
-m N ความยาวคลิปขั้นต่ำ (1)
-l N ความยาวลำดับขั้นต่ำที่เหลืออยู่ (15)
-x [N] ความยาวที่ตรงกันเพิ่มเติมจากความยาวของอแดปเตอร์
N =-1 : ค้นหาทั้งหมด N = 0 : ค้นหาเฉพาะความยาวอะแดปเตอร์
-e สิ้นสุดบรรทัด (ค่าเริ่มต้น)
-b ต้นสาย (ยังไม่รองรับ)
ใช้ fastq-clipper ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net
