fastq_masker - ออนไลน์ใน Cloud

โครงการ:

ชื่อ

fastq_masker - ปิดบังนิวคลีโอไทด์ด้วย 'N' (หรืออักขระอื่นๆ) ตามคุณภาพ

DESCRIPTION

การใช้งาน: fastq_masker [-h] [-v] [-q N] [-r C] [-z] [-i INFILE] [-o OUTFILE] ส่วนหนึ่งของ FASTX
Toolkit 0.0.14 โดย A. Gordon ([ป้องกันอีเมล])

[-h] = หน้าจอช่วยเหลือที่เป็นประโยชน์นี้

[-q N] = เกณฑ์คุณภาพ - นิวคลีโอไทด์ที่มีคุณภาพต่ำกว่าจะถูกปิดบัง

ค่าเริ่มต้นคือ 10

[-r C] = แทนที่นิวคลีโอไทด์คุณภาพต่ำด้วยอักขระ C ค่าเริ่มต้นคือ 'N'

[-z] = บีบอัดเอาต์พุตด้วย GZIP

[-i เข้าแฟ้ม]
= ไฟล์อินพุต FASTQ ค่าเริ่มต้นคือ STDIN

[-o OUTFILE] = ไฟล์เอาต์พุต FASTQ ค่าเริ่มต้นคือ STDOUT [-v] = ละเอียด -
รายงานจำนวนลำดับ

หากระบุ [-o]
รายงานจะถูกพิมพ์ไปที่ STDOUT

หากไม่ได้ระบุ [-o] (และเอาต์พุตไปที่ STDOUT) รายงานจะถูกพิมพ์ไปที่
สแตเดอร์

ใช้ fastq_masker ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net