gap5 - ออนไลน์ในคลาวด์

โครงการ:

ชื่อ

gap5 - โปรแกรมการประกอบจีโนม (ส่วนหนึ่งของแพ็คเกจ staden)

เรื่องย่อ

ช่องว่าง5 [-ro] [-maxseq ] [-maxdb ] [-skip_notes] [DATABASE_NAME.V]

DESCRIPTION

Gap5 เป็นโปรแกรมการประกอบจีโนม โปรแกรมมีเครื่องมือทั้งหมดที่จะ
คาดหวังจากโปรแกรมแอสเซมบลีพร้อมคุณสมบัติพิเศษมากมายและใช้งานง่ายมาก
อินเตอร์เฟซ. เวอร์ชันดั้งเดิมอธิบายไว้ใน Bonfield,JK, Smith,KF และ Staden,R. NS
โปรแกรมการประกอบลำดับดีเอ็นเอใหม่ กรดนิวคลีอิก 24, 4992-4999 (1995)

Gap5 นั้นใหญ่และทรงพลังมาก ทุกคนใช้ชุดย่อยของตัวเลือกและมี
วิธีที่ชื่นชอบในการเข้าถึงและใช้งาน แม้ว่าจะมีจำนวนมาก แต่ผู้ใช้ก็
ได้รับการสนับสนุนให้อ่านเอกสารทั้งหมดเพียงครั้งเดียวเพื่อค้นหาว่าคืออะไร
เป็นไปได้และแนวทางที่เหมาะสมกับงานของตนเองมากที่สุด อย่างน้อยที่สุด ทั้งหมดนี้
ควรอ่านบทเบื้องต้นเนื่องจากในระยะยาวจะช่วยประหยัดเวลา

OPTIONS

-ro อ่านอย่างเดียว

-maxseq N
ระยะเวลาฉันทามติสูงสุดรวมสูงสุดเบื้องต้น

-maxdb N
จำนวนสูงสุดเริ่มต้นของ contigs + การอ่าน

-(no_)เช็ค
(ห้าม) เรียกใช้ตรวจสอบฐานข้อมูลเมื่อเปิดฐานข้อมูล

-(no_)exec_notes
(ห้าม) ดำเนินการบันทึก OPEN/CLOS เมื่อฐานข้อมูลเปิดอยู่

-(no_)rawdata_note
(ห้าม) ใช้บันทึก RAWD แทน RAWDATA env ตัวแปร

-(no_)เซลล์
(อย่า) เริ่มต้นตัวเลือก contig เมื่อ db open

-แสดง
X แสดงผลเพื่อใช้

-ขนาดบิต N
ระบุขนาดบิตของไฟล์ aux สำหรับฐานข้อมูลใหม่ (32/64)

-ซิงค์ ใช้โหมดซิงโครนัสสำหรับเซิร์ฟเวอร์ดิสเพลย์ (การดีบัก)

-- สิ้นสุดรายการอาร์กิวเมนต์

ใช้ gap5 ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net