กระเทียม - ออนไลน์ในคลาวด์

โครงการ:

ชื่อ

กระเทียม - โปรแกรมสร้างภาพโมเลกุล

เรื่องย่อ

กระเทียม [จริง กระเทียม ตัวเลือก] [X11 ตัวเลือก] [ชื่อไฟล์]

DESCRIPTION

หน้าคู่มือนี้เอกสารสั้น ๆ กระเทียม, โปรแกรมสร้างภาพโมเลกุลฟรี
เอกสารประกอบที่กว้างขวางในรูปแบบ HTML และแหล่งที่มาอาจพบได้ที่บ้านกระเทียม
<URL:http://garlic.mefos.hr/garlic/>. ที่ตั้ง: คณะแพทยศาสตร์ มหาวิทยาลัย
เมืองโอซีเยก โครเอเชีย ยุโรป แพ็คเกจที่คอมไพล์ล่วงหน้าสำหรับ GNU/Linux distributions จำนวนหนึ่ง
สามารถใช้ได้ เหล่านี้รวมถึง Debian, SuSE, Mandriva, Linspire และอื่น ๆ อีกมากมาย
ดิสโทร เอกสาร HTML สามารถดาวน์โหลดและแตกไฟล์เพื่อใช้ในเครื่องได้ (แนะนำ
การใช้งาน) คุณจะพบคำอธิบายสั้นๆ ของโปรแกรมและรายการคำสั่ง
ตัวเลือกบรรทัด

กระเทียม เป็นโปรแกรมสร้างภาพระดับโมเลกุลที่เดิมเขียนขึ้นเพื่อการสืบสวนของ
โปรตีนเมมเบรน ตอนนี้อาจใช้เพื่อเห็นภาพและตัดต่อโปรตีนทั้งหมดและ
โมเลกุล รุ่นนี้รู้จักรูปแบบ PDB เวอร์ชัน 2.1; ดูไฟล์ต้นฉบับ pdb_atom.c
สำหรับรายละเอียดเกี่ยวกับรูปแบบนี้

OPTIONS

ตัวเลือกบรรทัดคำสั่งอาจแบ่งออกเป็นสองกลุ่ม: จริง (เฉพาะเจาะจง) กระเทียม ตัวเลือก และ X11
ตัวเลือก. ตัวเลือกอาจได้รับในลำดับใดก็ได้ ตัวเลือกทั้งหมดและค่าเริ่มต้นที่ฮาร์ดโค้ดคือ
ระบุไว้ในตารางด้านล่าง สำหรับแต่ละพารามิเตอร์ ค่าที่กำหนดผ่านบรรทัดคำสั่งคือ
ใช้ถ้ามี ถ้าไม่เช่นนั้น ค่าที่กำหนดไว้ใน .garlicrc ใช้ไฟล์. ถ้า .garlicrc
ไฟล์ไม่พร้อมใช้งาน หรือไม่มีรายการที่เกี่ยวข้องในไฟล์นี้ ฮาร์ดโค้ด
ใช้ค่าเริ่มต้น ตัวอย่าง .garlicrc ไฟล์ที่รวมอยู่ในแพ็คเกจเดิมมี
ค่าเท่ากับค่าเริ่มต้นที่ฮาร์ดโค้ด

กระเทียม ตัวเลือก:
-ชม, --ช่วยด้วย
พิมพ์วิธีใช้และออก

-ใน, --รุ่น
พิมพ์เวอร์ชันและออก

-NS, --ลงทะเบียน
ลงทะเบียนกระเทียม: แจ้งผู้เขียนว่าไซต์ของคุณมีการติดตั้งกระเทียมและมีคน
จะใช้โปรแกรมนี้ โดยการลงทะเบียน คุณสนับสนุนให้ผู้เขียน
พัฒนากระเทียมต่อไป คุณสามารถช่วยผู้เขียนเพื่อให้แน่ใจว่าการสนับสนุนสำหรับ
การพัฒนาต่อไป ตัวเลือกนี้จะส่งข้อความอีเมลสั้นๆ หนึ่งข้อความ ประกอบด้วย only
ส่วนหัวของข้อความอีเมลและคำว่า 'สวัสดี!' ถึง[ป้องกันอีเมล]>. โปรด
เรียกใช้กระเทียม -r หากคุณกำลังจะใช้โปรแกรมนี้ หากคุณไม่ได้เชื่อมต่อกับ
อินเทอร์เน็ต พิจารณาส่งข้อความสั้น ๆ จากระบบอื่น

-โนซิส ซ่อนไอคอนระบบพิกัด (มุมบนซ้าย)

-ไม่มีการควบคุม
ซ่อนหน้าต่างควบคุม (มุมบนขวา)

-ระบบเสียงสเตอริโอ
แสดงภาพสเตอริโอ

-แผ่นพื้น โหมด
โหมดแผ่นพื้นเริ่มต้น โหมดแผ่นพื้นที่ใช้ได้คือ: ปิด, ระนาบ (ค่าเริ่มต้น), ทรงกลม,
ครึ่งทรงกลม ทรงกระบอก และครึ่งกระบอก

-จางหาย โหมด
โหมดการซีดจางของสีเริ่มต้น โหมดที่ใช้ได้: ปิด, ระนาบ (ค่าเริ่มต้น), ทรงกลม,
ครึ่งทรงกลม ทรงกระบอก และครึ่งกระบอก

-เช่น จำนวน
รูปแบบการวาดอะตอมเริ่มต้น (ค่าเริ่มต้นแบบฮาร์ดโค้ด: 2)

-bs จำนวน
รูปแบบการวาดพันธบัตรเริ่มต้น (ค่าเริ่มต้นแบบฮาร์ดโค้ด: 2)

-fs จำนวน
จำนวนเริ่มต้นของพื้นผิวสีซีดจาง ระนาบขนาน ทรงกลมศูนย์กลาง หรือ
กระบอกสูบศูนย์กลางอาจใช้เป็นพื้นผิวที่ซีดจางได้ แฝดสาม RGB คือ
กำหนดให้กับแต่ละพื้นผิว พื้นผิวมีระยะห่างเท่ากัน อย่างน้อยหนึ่งอย่างและมากสุด
ควรกำหนดแปด อย่างน้อยสามสี (ซ้าย กลาง และขวา) คือ
กำหนดให้กับแต่ละอะตอมที่มองเห็นได้ ทั้งสามสีนี้ขึ้นอยู่กับตำแหน่งของ a
ให้อะตอมที่สัมพันธ์กับพื้นผิวที่ซีดจางที่ใกล้ที่สุดและกับสีที่กำหนดให้กับ
พื้นผิวเหล่านี้ รวมสีโดยใช้การถ่วงน้ำหนักเชิงเส้น

-lc สี
สีด้านซ้ายที่พื้นผิว i-th; ฉันอยู่ระหว่างศูนย์ถึงเจ็ด สายสี
ควรสอดคล้องกับ X11R5 ตัวอย่างเช่น สีน้ำเงิน อาจถูกกำหนดเป็นสีน้ำเงินหรือเป็น
RGB:0000/0000/FFFF เป็นต้น ตัวอย่างเช่น -lc4 RGB:BBBB/8888/4444 กำหนดสีด้านซ้าย
ที่พื้นผิวที่มีดัชนีเท่ากับสี่

-mc สี
สีกลางที่ผิว i-th

-rc สี
สีที่ถูกต้องที่พื้นผิวที่ i

-พีซี --print-config.php
พิมพ์ข้อมูลการกำหนดค่าและออก

-พีซีเอ็น พิมพ์ชื่อเคอร์เซอร์ไปที่ stdout และออก

- เข้าสู่ระบบ ไฟล์บันทึก
เขียนคำสั่งและข้อความไปยังล็อกไฟล์ ไฟล์จะถูกสร้างขึ้นในปัจจุบัน
ไดเรกทอรีการทำงาน หากไม่สามารถทำได้ ไฟล์บันทึกจะถูกสร้างขึ้นในหน้าแรกของผู้ใช้
ไดเรกทอรี

X11 ตัวเลือก:
-แสดง ชื่อที่แสดง
เซิร์ฟเวอร์ X ที่จะติดต่อ

-เรขาคณิต เรขาคณิต
รูปทรงหน้าต่าง (ค่าเริ่มต้น: เกือบทั้งหน้าจอ)

-บีจี สี
สีพื้นหลังของหน้าต่างหลัก (ค่าเริ่มต้นคือสีดำ)

-ฉ สี
สีพื้นหน้าของหน้าต่างหลัก (ค่าเริ่มต้น: สีขาว)

-ฉ ชื่อแบบอักษร
แบบอักษรข้อความ (ค่าเริ่มต้นคือ 10x20)

-tbg สี
สีพื้นหลังข้อความ (ค่าเริ่มต้นคือสีดำ)

-TFG สี
สีข้อความ (ค่าเริ่มต้นคือสีขาว)

-เคอร์เซอร์ ชื่อเคอร์เซอร์
ชื่อเคอร์เซอร์; ดู /usr/include/X11/cursorfont.h สำหรับชื่อ; ลบคำนำหน้า XC_

ใช้กระเทียมออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net