นี่คือคำสั่ง gt-sketch ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีของ OnWorks โดยใช้หนึ่งในเวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
gt-sketch - สร้างการแสดงภาพกราฟิกของไฟล์คำอธิบายประกอบ GFF3
เรื่องย่อ
gt ร่าง [ตัวเลือก ...] image_file [GFF3_file ...]
DESCRIPTION
-ท่อ [ใช่|ไม่]
ใช้โหมดไปป์ (เช่น แสดงคุณสมบัติ gff3 ทั้งหมดบน stdout) (ค่าเริ่มต้น: ไม่)
-Flattenfiles [ใช่|ไม่]
อย่าจัดกลุ่มแทร็กตามชื่อไฟล์ต้นทางและลบชื่อไฟล์ออกจากคำอธิบายแทร็ก
(ค่าเริ่มต้น: ไม่)
-seqid [เชือก]
ตัวระบุขอบเขตของลำดับเริ่มต้น: อันแรกในไฟล์
- เริ่มต้น [ความคุ้มค่า]
เริ่มต้นตำแหน่งเริ่มต้น: ภูมิภาคแรกเริ่ม
-End [ความคุ้มค่า]
ค่าเริ่มต้นของตำแหน่งสิ้นสุด: ภูมิภาคสุดท้ายสิ้นสุด
-ความกว้าง [ความคุ้มค่า]
ความกว้างของภาพเป้าหมาย (เป็นพิกเซล) (ค่าเริ่มต้น: 800)
สไตล์ [เชือก]
ไฟล์สไตล์ที่จะใช้ (ค่าเริ่มต้น: ไม่ได้กำหนด)
-รูปแบบ [...]
รูปแบบกราฟิกเอาต์พุต เลือกจาก png|pdf|svg|ps (ค่าเริ่มต้น: png)
-ป้อนข้อมูล [...]
รูปแบบข้อมูลอินพุต เลือกจาก gff|bed|gtf (ค่าเริ่มต้น: gff)
-แอดดินตรอน [ใช่|ไม่]
เพิ่มคุณสมบัติ intron ระหว่างคุณสมบัติ exon ที่มีอยู่ (ก่อนการวาด) (ค่าเริ่มต้น: ไม่)
-ไม่ปลอดภัย [ใช่|ไม่]
เปิดใช้งานโหมดไม่ปลอดภัยสำหรับไฟล์สไตล์ (ค่าเริ่มต้น: ไม่)
-v [ใช่|ไม่]
ละเอียด (ค่าเริ่มต้น: ไม่)
-บังคับ [ใช่|ไม่]
บังคับให้เขียนไปยังไฟล์เอาต์พุต (ค่าเริ่มต้น: ไม่)
-ช่วยด้วย
แสดงความช่วยเหลือและออก
-version
แสดงข้อมูลเวอร์ชันและออก
รายงาน ข้อบกพร่อง
รายงานจุดบกพร่องไปที่[ป้องกันอีเมล]>.
ใช้ gt-sketch ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net
