นี่คือคำสั่ง hmmconvert ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีของ OnWorks โดยใช้หนึ่งในเวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
hmmconvert - แปลงไฟล์โปรไฟล์เป็นรูปแบบ HMMER
เรื่องย่อ
อืมแปลง [ตัวเลือก]
DESCRIPTION
เทศกาล อืมแปลง ยูทิลิตีแปลงไฟล์โปรไฟล์อินพุตเป็นรูปแบบ HMMER ที่แตกต่างกัน
โดยค่าเริ่มต้น โปรไฟล์อินพุตสามารถอยู่ในรูปแบบ HMMER ใดก็ได้ รวมถึงรูปแบบเก่า/ล้าสมัย
จาก HMMER2, ASCII หรือไบนารี โปรไฟล์เอาต์พุตเป็นรูปแบบ HMMER3 ASCII ปัจจุบัน
อาจเป็น '-' (ขีด) ซึ่งหมายถึงการอ่านอินพุตนี้จาก สเตดิน แทนที่จะเป็นไฟล์.
OPTIONS
-h ช่วย; พิมพ์การแจ้งเตือนสั้นๆ เกี่ยวกับการใช้บรรทัดคำสั่งและตัวเลือกที่มีทั้งหมด
-a โปรไฟล์เอาต์พุตในรูปแบบข้อความ ASCII นี่คือค่าเริ่มต้น
-b โปรไฟล์เอาต์พุตในรูปแบบไบนารี
-2 เอาต์พุตในรูปแบบข้อความ HMMER2 ASCII ดั้งเดิม ในโหมด ls (glocal) สิ่งนี้ทำให้ HMMER3
โมเดลที่จะแปลงกลับไปเป็นค่าประมาณที่ใกล้เคียงของ HMMER2 เพื่อเปรียบเทียบ
การศึกษา
--outfmt
เอาต์พุตในรูปแบบข้อความ HMMER3 ASCII อื่นที่ไม่ใช่รูปแบบล่าสุด ถูกต้อง
ทางเลือกสำหรับ คือ 3/a ถึง 3/f รูปแบบปัจจุบันคือ 3/f และนี่คือ
ค่าเริ่มต้น. รูปแบบ 3/b ถูกใช้ในรุ่น HMMER3 อย่างเป็นทางการ และอื่นๆ
ถูกนำมาใช้ในรุ่นทดสอบต่างๆ
ใช้ hmmconvert ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net
