นี่คือคำสั่ง hmmlogo ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสติ้งฟรีของ OnWorks โดยใช้หนึ่งในเวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
hmmlogo - ได้รับ HMM สร้างข้อมูลที่จำเป็นในการสร้างโลโก้ HMM
เรื่องย่อ
อืมโลโก้ [ตัวเลือก]
DESCRIPTION
อืมโลโก้ คำนวณความสูงของตัวอักษรและพารามิเตอร์อินเดลที่สามารถใช้สร้างโปรไฟล์ได้
โลโก้ HM. เครื่องมือนี้เป็นอินเทอร์เฟซบรรทัดคำสั่งสำหรับข้อมูลส่วนใหญ่
ที่อยู่ภายใต้เซิร์ฟเวอร์โลโก้ Skylign (skylign.org)
โดยค่าเริ่มต้น อืมโลโก้ พิมพ์ตารางความสูงของตัวอักษรต่อตำแหน่ง (ขึ้นอยู่กับ
วิธีความสูงที่ร้องขอ) จากนั้นพิมพ์ตารางความน่าจะเป็นของช่องว่างต่อตำแหน่ง
ในโลโก้ทั่วไป ความสูงรวมของกองตัวอักษรสำหรับหนึ่งตำแหน่งขึ้นอยู่กับ
เนื้อหาข้อมูลของตำแหน่งและความสูงของกองนั้นแบ่งตาม
ความน่าจะเป็นที่ปล่อยออกมาของตัวอักษรของตัวอักษร
OPTIONS
-h ช่วย; พิมพ์การแจ้งเตือนสั้นๆ เกี่ยวกับการใช้บรรทัดคำสั่งและตัวเลือกที่มีทั้งหมด
--height_relent_all
ความสูงทั้งหมด = เอนโทรปีสัมพัทธ์ (เนื้อหาข้อมูล aka); จดหมายทั้งหมดจะได้รับ a
ความสูงเป็นบวก (ค่าเริ่มต้น)
--height_relent_abovebg
ความสูงทั้งหมด = เอนโทรปีสัมพัทธ์ (เนื้อหาข้อมูล aka); เฉพาะตัวอักษรที่มีด้านบน-
ความน่าจะเป็นพื้นหลังจะได้รับความสูงเป็นบวก
--ความสูง_คะแนน
ความสูงทั้งหมด = ผลรวมของคะแนนของตัวอักษรที่มีคะแนนบวก ความสูงของตัวอักษรขึ้นอยู่กับ
คะแนนของจดหมายนั้นในตำแหน่งนั้น เฉพาะตัวอักษรที่มีพื้นหลังด้านบน
ความน่าจะเป็น (คะแนนบวก) จะได้รับความสูงเป็นบวก (โปรดทราบว่ามีเพียงตัวอักษร
ความสูงมีความหมาย - ความสูงของกองไม่มีความหมายโดยธรรมชาติ)
--no_indel
อย่าพิมพ์ตารางความน่าจะเป็นอินเดล
ใช้ hmmlogo ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net
