uc-echo - ออนไลน์ในคลาวด์

โครงการ:

ชื่อ

uc-echo - การแก้ไขข้อผิดพลาดแบบอ่านสั้น

เรื่องย่อ

uc-ก้อง [ตัวเลือก] read_file_name

OPTIONS

-h, --ช่วยด้วย
แสดงข้อความช่วยเหลือนี้และออก

-o OUTPUT_FILENAME --เอาท์พุท=OUTPUT_FILENAME
ชื่อไฟล์เอาต์พุต

-l LOG_FILENAME, --บันทึก=LOG_FILENAME
ชื่อไฟล์บันทึก

--DD=TMP_DIRECTORY, --tmp_dir=TMP_DIRECTORY
ไดเร็กทอรีข้อมูลชั่วคราว

-u คสช. --ncpu=คสช
จำนวนกระบวนการที่ใช้ในการฝึกอบรม

-b บีไซส์ --block_size=ขนาด
แบ่งข้อมูลออกเป็นบล็อคตามขนาดที่กำหนด

--ไม่=แนช, --n_hash_block=แนช
แบ่งตารางแฮชออกเป็น n ตาราง

--rm=อ่าน_ผสาน, --read_merge_size=อ่าน_ผสาน
รวม n ตารางแฮชในแต่ละครั้ง

--หืม=HASH_MERGE, --hash_merge_batch_size=HASH_MERGE
รวม n adjacency รายการเข้าด้วยกัน

-k K, --กม=K
ขนาด k-mer ใช้สำหรับแฮช

-e E, --min_error_tolerance=E
ค่าเผื่อข้อผิดพลาดขั้นต่ำสำหรับการค้นหาพารามิเตอร์

-E E, --max_error_tolerance=E
ค่าเผื่อข้อผิดพลาดสูงสุดสำหรับการค้นหาพารามิเตอร์

--ห๊ะ=H, --min_minimum_overlap=H
ความยาวทับซ้อนขั้นต่ำต่ำสุดสำหรับการค้นหาพารามิเตอร์

--hH=H, --max_minimum_overlap=H
ความยาวทับซ้อนต่ำสุดสูงสุดสำหรับการค้นหาพารามิเตอร์

--h_rate=H_เรต, --เฮเทอโรไซกัส_เรท=H_เรต
อัตราสำหรับไซต์ที่แตกต่างกัน

--model_selection_size=MIZE
ขนาดชุดข้อมูลการเลือกแบบจำลอง

--keep_all_files
เก็บไฟล์ชั่วคราวทั้งหมด ตามค่าเริ่มต้น ไฟล์ชั่วคราวจะถูกลบโดยอัตโนมัติ

-h, --ช่วยด้วย
แสดงข้อความช่วยเหลือนี้และออก

-o OUTPUT_FILENAME --เอาท์พุท=OUTPUT_FILENAME
ชื่อไฟล์เอาต์พุต

-l LOG_FILENAME, --บันทึก=LOG_FILENAME
ชื่อไฟล์บันทึก

--DD=TMP_DIRECTORY, --tmp_dir=TMP_DIRECTORY
ไดเร็กทอรีข้อมูลชั่วคราว

-u คสช. --ncpu=คสช
จำนวนกระบวนการที่ใช้ในการฝึกอบรม

-b บีไซส์ --block_size=ขนาด
แบ่งข้อมูลออกเป็นบล็อคตามขนาดที่กำหนด

--ไม่=แนช, --n_hash_block=แนช
แบ่งตารางแฮชออกเป็น n ตาราง

--rm=อ่าน_ผสาน, --read_merge_size=อ่าน_ผสาน
รวม n ตารางแฮชในแต่ละครั้ง

--หืม=HASH_MERGE, --hash_merge_batch_size=HASH_MERGE
รวม n adjacency รายการเข้าด้วยกัน

-k K, --กม=K
ขนาด k-mer ใช้สำหรับแฮช

-e E, --min_error_tolerance=E
ค่าเผื่อข้อผิดพลาดขั้นต่ำสำหรับการค้นหาพารามิเตอร์

-E E, --max_error_tolerance=E
ค่าเผื่อข้อผิดพลาดสูงสุดสำหรับการค้นหาพารามิเตอร์

--ห๊ะ=H, --min_minimum_overlap=H
ความยาวทับซ้อนขั้นต่ำต่ำสุดสำหรับการค้นหาพารามิเตอร์

--hH=H, --max_minimum_overlap=H
ความยาวทับซ้อนต่ำสุดสูงสุดสำหรับการค้นหาพารามิเตอร์

--h_rate=H_เรต, --เฮเทอโรไซกัส_เรท=H_เรต
อัตราสำหรับไซต์ที่แตกต่างกัน

--model_selection_size=MIZE
ขนาดชุดข้อมูลการเลือกแบบจำลอง

--keep_all_files
เก็บไฟล์ชั่วคราวทั้งหมด ตามค่าเริ่มต้น ไฟล์ชั่วคราวจะถูกลบโดยอัตโนมัติ

ใช้ uc-echo ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net