นี่คือแอป Linux ชื่อ Alphafold ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรุ่นล่าสุดได้ในชื่อ Alphafoldv2.3.2.zip สามารถเรียกใช้ออนไลน์ได้ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ออนไลน์ชื่อ Alphafold พร้อม OnWorks ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OnWorks Linux หรือ Windows ออนไลน์ หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ MACOS จากเว็บไซต์นี้
- 5. จาก OnWorks Linux OS คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่น ติดตั้ง และเรียกใช้
ภาพหน้าจอ
Ad
อัลฟ่าโฟลด์
DESCRIPTION
แพ็คเกจนี้จัดเตรียมการใช้งานไพพ์ไลน์การอนุมานของ AlphaFold v2.0 นี่เป็นโมเดลใหม่ทั้งหมดที่ถูกป้อนใน CASP14 และเผยแพร่ใน Nature เพื่อความง่าย เราเรียกโมเดลนี้ว่า AlphaFold ตลอดทั้งส่วนที่เหลือของเอกสารนี้ สิ่งพิมพ์ใดๆ ที่เปิดเผยผลการวิจัยที่เกิดจากการใช้ซอร์สโค้ดนี้หรือพารามิเตอร์แบบจำลอง ควรอ้างอิงเอกสาร AlphaFold โปรดดูข้อมูลเพิ่มเติมสำหรับคำอธิบายโดยละเอียดของวิธีการ คุณสามารถใช้ AlphaFold เวอร์ชันที่เรียบง่ายกว่าเล็กน้อยกับโน้ตบุ๊ก Colab หรือเวอร์ชันที่ชุมชนสนับสนุน ขนาดการดาวน์โหลดรวมสำหรับฐานข้อมูลแบบเต็มจะอยู่ที่ประมาณ 415 GB และขนาดทั้งหมดเมื่อคลายซิปคือ 2.2 TB โปรดตรวจสอบให้แน่ใจว่าคุณมีพื้นที่ว่างบนฮาร์ดไดรฟ์ แบนด์วิดท์ และเวลาเพียงพอในการดาวน์โหลด เราแนะนำให้ใช้ SSD เพื่อประสิทธิภาพการค้นหาทางพันธุกรรมที่ดีขึ้น
คุณสมบัติ
- AlphaFold ต้องการฐานข้อมูลทางพันธุกรรม (ลำดับ) หลายฐานข้อมูลเพื่อเรียกใช้
- แม้ว่ารหัส AlphaFold จะได้รับอนุญาตภายใต้สัญญาอนุญาต Apache 2.0 พารามิเตอร์ AlphaFold จะพร้อมใช้งานสำหรับการใช้งานที่ไม่ใช่เชิงพาณิชย์
- โมเดล 5 แบบที่ใช้ระหว่าง CASP14 และได้รับการตรวจสอบอย่างครอบคลุมสำหรับคุณภาพการทำนายโครงสร้าง
- โมเดล 5 pTM ซึ่งปรับแต่งมาอย่างดีเพื่อผลิต pTM
- วิธีที่ง่ายที่สุดในการรัน AlphaFold คือการใช้สคริปต์ Docker ที่ให้มา
- โดยค่าเริ่มต้น Alphafold จะพยายามใช้อุปกรณ์ GPU ที่มองเห็นได้ทั้งหมด
ภาษาโปรแกรม
หลาม
หมวดหมู่
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/alphafold.mirror/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา
