นี่คือแอพลินุกซ์ชื่อ BamBam ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรุ่นล่าสุดเป็น bambam-1.4.tgz สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ออนไลน์ชื่อ BamBam พร้อม OnWorks ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OnWorks Linux หรือ Windows ออนไลน์ หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ MACOS จากเว็บไซต์นี้
- 5. จาก OnWorks Linux OS คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่น ติดตั้ง และเรียกใช้
BamBam
Ad
DESCRIPTION
แบมแบมมีเครื่องมือมากมายสำหรับการวิเคราะห์ข้อมูลการหาลำดับดีเอ็นเอในยุคต่อไป มีเครื่องมือสำหรับการเรียก SNP และอินเดล การระบุการลบขนาดใหญ่ การจัดตารางจำนวนการอ่านที่แมป การวิเคราะห์เมทิลเลชัน และอื่นๆ
ขึ้นอยู่กับ SAMtools (http://samtools.sourceforge.net/) และ BAMtools (https://github.com/pezmaster31/bamtools). ยังใช้ BioPerl ซึ่งรวมอยู่ใน tarball ดาวน์โหลด
คุณสมบัติ
- โทร SNPs และ indels
- ใส่จีโนไทป์
- สร้างลำดับฉันทามติ
- จัดตารางจำนวนการอ่านที่แมป (RNA-seq)
- อนุมาน haplotype phasing ด้วย K-means clustering
- วิเคราะห์ DNA methylation (bisulfite-sequencing)
ผู้ชม
วิทยาศาสตร์/การวิจัย
ภาษาโปรแกรม
เพิร์ล, C++
หมวดหมู่
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/bambam/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา
