Name: COGsoft ที่จะทำงานใน Linux ดาวน์โหลดออนไลน์สำหรับ Linux
Brand: OnWorks
SKU: 149686c473a38119a90c8352da670483
Availability: OnlineOnly
Rating: 4.5 (1816 reviews)

นี่คือแอป Linux ชื่อ COGsoft เพื่อทำงานใน Linux ออนไลน์ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรุ่นล่าสุดได้เป็น COGsoft.04.19.2012.tgz สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน

ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ทางออนไลน์ที่ชื่อว่า COGsoft เพื่อเรียกใช้ใน Linux ออนไลน์ด้วย OnWorks ฟรี

ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:

- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ

- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ

- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว

- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OnWorks Linux หรือ Windows ออนไลน์ หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ MACOS จากเว็บไซต์นี้

- 5. จาก OnWorks Linux OS คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ

- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่น ติดตั้ง และเรียกใช้

ดาวน์โหลดแอป เรียกใช้ใน Ubuntu วิ่งใน Fedora เรียกใช้ใน Windows Sim เรียกใช้ใน MACOS Sim

COGsoft ให้ทำงานใน Linux ออนไลน์

DESCRIPTION

ซอฟต์แวร์สำหรับสร้าง Clusters of Orthologous Groups (มีอัลกอริธึม EdgeSearch ใหม่) อ้างอิงล่าสุด: Kristensen DM, Kannan L, Coleman MK, Wolf YI, Sorokin A, Koonin EV, Mushegian A. Bioinformatics 2010

คุณสมบัติ

คำอธิบายของจุดแข็ง/จุดอ่อนของวิธีการต่างๆ: Kristensen DM, Wolf YI, Mushegian AR, Koonin EV วิธีการคำนวณสำหรับการอนุมานวิทยายีน Bioinform สั้น ๆ 2011 ก.ย.;12(5):379-91. Epub 2011 19 มิ.ย. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21690100
การอ้างอิงอัลกอริทึม: Kristensen DM, Kannan L, Coleman MK, Wolf YI, Sorokin A, Koonin EV, Mushegian A. อัลกอริธึมพหุนามต่ำสำหรับการประกอบคลัสเตอร์ของกลุ่ม orthologous จากการจับคู่ที่ดีที่สุดที่สมมาตรระหว่างกัน ชีวสารสนเทศศาสตร์ 2010 มิ.ย. 15;26(12):1481-7. Epub 2010 2 พฤษภาคม http://bioinformatics.oxfordjournals.org/cgi/content/abstract/btq229?ijkey=zD7TIWnncGvDGYE&keytype=ref
ดี/ทบทวนอย่างละเอียดของ orthologs/COGs: Koonin EV. ออร์โธล็อก พาราล็อก และจีโนมวิวัฒนาการ Annu รายได้ Genet. 2005;39:309-38. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16285863
กระดาษ COG ต้นฉบับ: Tatusov RL, Koonin EV, Lipman DJ มุมมองจีโนมในครอบครัวโปรตีน ศาสตร์. 1997 ต.ค. 24;278(5338):631-7. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9381173
ฐานข้อมูล COG: Tatusov RL, Galperin MY, Natale DA, Koonin EV ฐานข้อมูล COG: เครื่องมือสำหรับการวิเคราะห์ระดับจีโนมของฟังก์ชันและวิวัฒนาการของโปรตีน กรดนิวคลีอิก 2000 ม.ค. 1;28(1):33-6. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10592175
เว็บเพจ Koonin lab: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/research/groups/koonin/
เว็บไซต์ FTP อย่างเป็นทางการ: ftp.ncbi.nih.gov/pub/wolf/COGs/COGsoft/ (แม้ว่าในขณะนี้ readme จะชี้ไปที่หน้า sourceforge)

ผู้ชม

วิทยาศาสตร์/การวิจัย

ส่วนติดต่อผู้ใช้

บรรทัดคำสั่ง

ภาษาโปรแกรม

C + +

นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/cogtriangles/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา