นี่คือแอป Linux ชื่อ HMCan ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรีลีสล่าสุดเป็น HMCan.tar.gz สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ออนไลน์ชื่อ HMCan พร้อม OnWorks ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OnWorks Linux หรือ Windows ออนไลน์ หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ MACOS จากเว็บไซต์นี้
- 5. จาก OnWorks Linux OS คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่น ติดตั้ง และเรียกใช้
HMCan
Ad
DESCRIPTION
HMCan เป็นเครื่องมือที่ใช้ Hidden Markov Model ซึ่งพัฒนาขึ้นเพื่อตรวจหาการดัดแปลงฮิสโตนในข้อมูล ChIP-seq ของมะเร็ง ใช้ขั้นตอนการแก้ไขสามขั้นตอนกับข้อมูล: การแก้ไขหมายเลขสำเนา การแก้ไขอคติ GC และการแก้ไขระดับเสียง
ในการรัน HMCan เราจำเป็นต้องมีไฟล์การจัดตำแหน่งเป้าหมายของ ChIP-seq และไฟล์การจัดตำแหน่งการควบคุม จำเป็นต้องมีการกำหนดค่าบางอย่างเช่นกัน สำหรับข้อมูลเพิ่มเติม โปรดตรวจสอบไฟล์ README
ผู้เขียน: Haitham Ashoor
ติดต่อ: สถาบัน Valentina Boeva Curie
Haitham Ashoor คิงอับดุลลาห์มหาวิทยาลัยวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี
ภาษาโปรแกรม
C + +
หมวดหมู่
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/hmcan/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา
