นี่คือแอป Linux ชื่อ kallisto ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรีลีสล่าสุดเป็น kallisto_windows-v0.50.0.zip สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ออนไลน์ชื่อ kallisto พร้อม OnWorks ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OnWorks Linux หรือ Windows ออนไลน์ หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ MACOS จากเว็บไซต์นี้
- 5. จาก OnWorks Linux OS คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่น ติดตั้ง และเรียกใช้
ภาพหน้าจอ
Ad
คัลลิสโต
DESCRIPTION
kallisto เป็นโปรแกรมสำหรับการหาปริมาณการถอดรหัสจากข้อมูล RNA-Seq ที่ใกล้เคียงที่สุด หรือโดยทั่วไปแล้วของลำดับเป้าหมายโดยใช้การอ่านลำดับที่มีปริมาณงานสูง โดยอิงจากแนวคิดในการใช้การจัดตำแหน่งเทียมเพื่อระบุความเข้ากันได้ของการอ่านและเป้าหมายอย่างรวดเร็ว โดยไม่ต้องมีการจัดตำแหน่ง
ตามเกณฑ์มาตรฐานที่ทำบนคอมพิวเตอร์เดสก์ท็อป Mac kallisto สามารถหาปริมาณ RNA-seq จำนวน 30 ล้านอ่านในเวลาน้อยกว่า 3 นาทีด้วยลำดับการอ่านและดัชนีการถอดรหัส ซึ่งในตัวมันเองอาจใช้เวลามากกว่า 10 นาทีในการสร้าง และเนื่องจากใช้การจัดตำแหน่งเทียม จึงมีประสิทธิภาพต่อข้อผิดพลาดในการอ่านและเก็บรักษาข้อมูลสำคัญที่จำเป็นสำหรับการหาปริมาณ สิ่งนี้ทำให้ kallisto ไม่เพียงแต่เร็วแต่มีความแม่นยำสูงอีกด้วย ในการวัดประสิทธิภาพหลายๆ อย่าง มันมีประสิทธิภาพเหนือกว่าเครื่องมือที่มีอยู่อย่างมากด้วยซ้ำ
คุณสมบัติ
- ใช้การจัดตำแหน่งเทียม
- รวดเร็วและแม่นยำ
- สามารถวิเคราะห์ RNA-Seq จำนวนมากในเชิงปริมาณได้ด้วย sleuth
- สามารถใช้กับ bustools เพื่อประมวลผลข้อมูล RNA-seq เซลล์เดียวล่วงหน้าได้
ภาษาโปรแกรม
C
หมวดหมู่
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/kallisto.mirror/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา
