นี่คือแอป Linux ชื่อ MIPGen เพื่อทำงานใน Linux ออนไลน์ ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรุ่นล่าสุดได้เป็น mipgen_v15.tar.gz สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ทางออนไลน์ที่ชื่อว่า MIPGen เพื่อทำงานใน Linux ออนไลน์ด้วย OnWorks ได้ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OnWorks Linux หรือ Windows ออนไลน์ หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ MACOS จากเว็บไซต์นี้
- 5. จาก OnWorks Linux OS คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่น ติดตั้ง และเรียกใช้
ภาพหน้าจอ
Ad
MIPGen เพื่อรันบน Linux ออนไลน์
DESCRIPTION
เครื่องกำเนิดศักยภาพปฏิสัมพันธ์ระดับโมเลกุลMIPGEN เป็นโปรแกรมหลามที่จะคำนวณกริดศักยภาพการโต้ตอบระดับโมเลกุล
เหนือโมเลกุลที่กำหนด ซึ่งอาจเป็นโปรตีนหรือสารประกอบอินทรีย์ขนาดเล็ก (ยา)
ผลลัพธ์จะเป็นชุดของกริดที่มีรูปแบบ DX (*.dx) ที่ผู้ใช้จะสามารถทำได้
เพื่อให้เห็นภาพโดยใช้โปรแกรมสร้างภาพระดับโมเลกุล เช่น VMD, PyMol, Chimera...
สำหรับข้อมูลเพิ่มเติมเกี่ยวกับการพึ่งพาและการใช้งาน โปรดอ่านเอกสารประกอบ
ผู้ใช้ยินดีที่จะโพสต์ข้อบกพร่องหรือคำขอใด ๆ ภายใต้เมนู BUGS & REQUESTS (จำเป็นต้องมีบัญชี sourceforge)
คุณสมบัติ
- การสร้าง MIP อัตโนมัติโดยสมบูรณ์ด้วยไฟล์ PDB อย่างง่าย
- รหัสโอเพนซอร์ซ ผู้ใช้ยินดีที่จะสนับสนุนการขยายการซักถามหรือปรับปรุงโค้ด
- คำนวณศักยภาพอันตรกิริยาของโมเลกุลตามตารางเหนือเปปไทด์และระบบโมเลกุลขนาดใหญ่อื่นๆ (อาจยังคงช้าสำหรับระบบขนาดใหญ่)
- คำนวณ MIP เหนือโมเลกุลขนาดเล็ก
- โพรบที่ปรับแต่งได้ ใช้งานแล้ว: Hydrophobic, ผู้บริจาค H-Bond, ตัวรับ H-Bond และหัววัดไฟฟ้าสถิต
- การกำหนดประเภทอะตอมโดยอัตโนมัติให้กับโมเลกุลและโปรตีนขนาดเล็กโดยเชื่อมต่อกับโอเพนซอร์ส Antechamber และ tLeap จากแพ็คเกจ AmbertTools (http://ambermd.org)
ผู้ชม
วิทยาศาสตร์/การวิจัย ผู้ใช้ขั้นสูง นักพัฒนา ผู้ใช้ปลายทาง/เดสก์ท็อป
ส่วนติดต่อผู้ใช้
คอนโซล/เทอร์มินัล
ภาษาโปรแกรม
หลาม
สภาพแวดล้อมฐานข้อมูล
SQLite
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/mipgen/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา
