miRNA Temporal Analyzer (mirnaTA) เพื่อทำงานใน Linux ออนไลน์

นี่คือแอป Linux ชื่อ miRNA Temporal Analyzer (mirnaTA) เพื่อทำงานใน Linux ออนไลน์ ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรีลีสล่าสุดเป็น mirnaTA_v1.2.3.tar.gz สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน

ภาพหน้าจอ

miRNA Temporal Analyzer (mirnaTA) เพื่อทำงานใน Linux ออนไลน์

DESCRIPTION

microRNA Temporal Analyzer (mirnaTA) เป็นเครื่องมือชีวสารสนเทศที่สามารถใช้ในการระบุ miRNA ที่แสดงความแตกต่างในการศึกษาชั่วคราว มีการใช้งานในแพ็คเกจ Perl และ R (>= 2.13.0) และสามารถทำงานได้ในหลายแพลตฟอร์ม เช่น Linux, Mac และ Windows mirnaTA กำหนดให้ผู้ใช้ต้องจัดเตรียมข้อมูลจากจุดเวลาอย่างน้อยสองจุดและวิเคราะห์จุดเวลาสูงสุด 20 จุด ในการทำให้ข้อมูลเป็นมาตรฐานและขจัดความแปรปรวนทางเทคนิค ได้ใช้การแปลงควอนไทล์ปกติ (NQT) และข้อมูลที่ทำให้เป็นมาตรฐานจะได้รับการวิเคราะห์โดยใช้แบบจำลองการถดถอยเชิงเส้นเพื่อค้นหา miRNA ใดๆ ที่แสดงความแตกต่างในลักษณะเชิงเส้น miRNA ใดๆ ที่มีค่า P<0.05 ถือว่ามีนัยสำคัญทางสถิติ miRNA ที่เหลืออยู่ซึ่งไม่พอดีกับแบบจำลองเชิงเส้นจะได้รับการวิเคราะห์เพิ่มเติมในสองวิธีที่ต่างกัน: (1) ถ้าจำนวนจุดเวลา <3, CDF ของการแจกแจงแบบปกติ และ (2) ถ้าจำนวนจุดเวลา >= 3 ใช้ ANOVA
http://www.gigasciencejournal.com/content/3/1/20

คุณสมบัติ

• เครื่องวิเคราะห์เวลา miRNA
• การแปลงควอนไทล์ปกติ (NQT)
• มากถึง 20 คะแนนเวลา
• แพ็คเกจอาร์
• Perl
• แผนที่ความร้อน
• วิ่งง่าย
• อินเทอร์เฟซ HTML แบบกราฟิก
• เอาท์พุทง่าย

ผู้ชม

วิทยาศาสตร์/การวิจัย

ภาษาโปรแกรม

Perl

นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/mirnata/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา