นี่คือแอป Linux ชื่อ mitoMaker ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรุ่นล่าสุดได้ในชื่อ mitoMaker_1.0rc2.tar.gz สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ออนไลน์ชื่อ mitoMaker พร้อม OnWorks ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OnWorks Linux หรือ Windows ออนไลน์ หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ MACOS จากเว็บไซต์นี้
- 5. จาก OnWorks Linux OS คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่น ติดตั้ง และเรียกใช้
ภาพหน้าจอ
Ad
มิโตะเมคเกอร์
DESCRIPTION
Mitomaker เป็นไพพ์ไลน์แรปเปอร์ ตัววิเคราะห์ผลลัพธ์และตัวบันทึกอัตโนมัติที่เขียนใน Python v2.7 ซึ่งด้วยความช่วยเหลือของโปรแกรมอื่น บิลด์ วิเคราะห์ ค้นหาบิลด์ที่ดีที่สุดและใส่คำอธิบายประกอบของจีโนมเป้าหมาย (เช่น ไมโตคอนเดรีย และคลอโรพลาส) สามารถใช้กับเป้าหมายอื่นได้ เช่น ยีนจำเพาะ หรือทรานสคริปโตม แม้ว่าจะไม่ใช่เป้าหมายหลักหรือไม่ได้รับการทดสอบอย่างละเอียดถี่ถ้วนก็ตาม
หลังจากพยายามสร้างยีน mitochondrial ต่างๆ ในห้องทดลองหลายครั้ง ไปป์ไลน์ทั่วไปก็เริ่มปรากฏขึ้น: ประกอบการอ่านด้วย MIRA หรือ SOAPdenovo-Trans มองหาโครง/ส่วนต่อที่ตรงกับสปีชีส์ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิด ตรวจสอบเพื่อดูว่าทั้งหมดหรือไม่ ลักษณะของจีโนมที่คาดไว้มีอยู่ (เนื่องจากไมโตคอนเดรียได้รับการอนุรักษ์ไว้อย่างดี) ให้ตรวจดูว่าชุดประกอบอาจมีการหมุนเวียนเป็นวงกลมหรือไม่ (เนื่องจากเป็น DNA แบบวงกลม) หากไม่มีคุณสมบัติใด หรือไม่มีการหมุนเวียน ให้ลองประกอบอีกครั้งด้วยพารามิเตอร์แอสเซมเบลอร์ที่แตกต่างกัน (ส่วนใหญ่เป็น k-mer) ล้างและทำซ้ำจนกว่าจะพบโครงสร้างที่ดีที่สุด
คุณสมบัติ
- ชีวสารสนเทศศาสตร์
- Plastid สร้างไปป์ไลน์อัตโนมัติ
- เครื่องวิเคราะห์จีโนม
- การประกอบพลาสติก
ผู้ชม
วิทยาศาสตร์/การวิจัย
ส่วนติดต่อผู้ใช้
คอนโซล/เทอร์มินัล
ภาษาโปรแกรม
หลาม
หมวดหมู่
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/plastidmaker/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา
