นี่คือแอป Linux ชื่อ MSL ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรุ่นล่าสุดได้เป็น mslib-1.1.0.9.tgz สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ออนไลน์ชื่อ MSL พร้อม OnWorks ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OnWorks Linux หรือ Windows ออนไลน์ หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ MACOS จากเว็บไซต์นี้
- 5. จาก OnWorks Linux OS คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่น ติดตั้ง และเรียกใช้
MSL
Ad
DESCRIPTION
MSL เป็นไลบรารี C++ ที่ช่วยให้สามารถศึกษาโมเลกุลขนาดใหญ่ด้วยคอมพิวเตอร์ได้
ไลบรารี MSL ไม่ใช่โปรแกรม (แม้ว่าจะมีการแจกจ่ายแอพพลิเคชั่นบางตัว) แต่เป็นเครื่องมือสำหรับนักวิทยาศาสตร์ในการเขียนโค้ดวิธีการสร้างแบบจำลองระดับโมเลกุลของตนเอง
ปรัชญา
เป้าหมายหลักคือการสร้างชุดเครื่องมือที่เปิดใช้งานการศึกษาทางคอมพิวเตอร์ของโมเลกุลขนาดใหญ่ได้อย่างง่ายดายในทุกระดับ ตั้งแต่การดำเนินการอย่างง่าย (เช่น โหลด PDB และวัดระยะทางหรือแก้ไขไดฮีดรัล) ไปจนถึงการใช้งานที่ซับซ้อน (การสร้างแบบจำลองโปรตีนหรือ ออกแบบ).
MSL ได้รับการพัฒนาใน Senes Lab ที่ University of Wisconsin-Madison และโดยทีมนักพัฒนา/ผู้ใช้จากห้องปฏิบัติการวิจัยอื่นๆ
อ้างอิง:
คูลป์ DW, ซูบรามาเนียม เอส, โดนัลด์ JE, ฮันนิแกน บีที, มูลเลอร์ บีเค, กริกอเรียน จี, เซเนส เอ.
สารสนเทศเชิงโครงสร้าง การสร้างแบบจำลอง และการออกแบบด้วยโอเพ่นซอร์ส Molecular Software Library (MSL)
เจ คอมพิวเตอร์ เคมี. ฉบับปี 2012 33 หน้า 1645-61
ดาวน์โหลดบทความได้ที่ http://dx.doi.org/10.1002/jcc.22968
คุณสมบัติ
- ความสามารถในการจัดเก็บและการสลับระหว่างพิกัดอะตอมหลายตัว สำหรับการเปลี่ยนแปลงเชิงโครงสร้างและการแสดงแบบโรตาเมริกของความอิสระของโครงสร้างของโซ่ด้านข้าง
- ความสามารถในการสร้างและจัดเก็บข้อมูลเอกลักษณ์ของสารตกค้างหลายตัว (เช่น LEU, ILE, ALA) ที่ตำแหน่งและสลับไปมาระหว่างกันได้
- # สนามแรง CHARMM และฟังก์ชันพลังงานอื่นๆ
- การแปลงรูปแบบต่างๆ เช่น การแปล การหมุน และการจัดตำแหน่ง
- อัลกอริธึมการค้นหา เช่น Monte Carlo, Dead End Elimination และ Self Consistent Mean Field Monte Carlo. การสุ่มตัวอย่างแกนหลัก
- รุ่นคริสตัลขัดแตะ
- รองรับไลบรารี rotamer
- การปรับเปลี่ยนและการสร้างกระดูกสันหลัง
- แพลตฟอร์มที่รองรับ: Linux, MacOS
ผู้ชม
วิทยาศาสตร์/การวิจัย
ภาษาโปรแกรม
C + +
หมวดหมู่
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/mslib/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา
