นี่คือแอป Linux ชื่อ PBSuite ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรุ่นล่าสุดเป็น PBSuite_15.8.24.tgz สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ออนไลน์ชื่อ PBSuite พร้อม OnWorks ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OnWorks Linux หรือ Windows ออนไลน์ หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ MACOS จากเว็บไซต์นี้
- 5. จาก OnWorks Linux OS คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่น ติดตั้ง และเรียกใช้
ภาพหน้าจอ:
พีบีสวีท
รายละเอียด:
ปัจจุบันนี้โฮสต์สองโครงการที่สร้างและดูแลโดย Adam English
PBJelly - เครื่องมืออัปเกรดจีโนม
PBHoney - เครื่องมือค้นพบรูปแบบโครงสร้าง
ทั้งสองมีอยู่ในรหัส PBSuite ที่พบในการดาวน์โหลด
----- พีเจลลี่ -----
อ่านกระดาษ
http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0047768
PBJelly เป็นไปป์ไลน์แบบอัตโนมัติที่จัดลำดับการอ่านแบบยาว (เช่น การอ่าน PacBio RS หรือการอ่าน 454 แบบยาวในรูปแบบ fasta) ไปจนถึงการประกอบแบบร่างที่มีความมั่นใจสูง PBJelly เติมหรือลดช่องว่างที่จับได้มากที่สุดเท่าที่เป็นไปได้เพื่อสร้างจีโนมแบบร่างที่ได้รับการอัพเกรด
----- พีบีฮันนี่ -----
อ่านกระดาษ
http://www.biomedcentral.com/1471-2105/15/180/abstract
PBHoney เป็นการนำเอาวิธีการระบุตัวแปรสองวิธีมาใช้ ซึ่งออกแบบมาเพื่อใช้ประโยชน์จากความสามารถในการแมปที่สูงของการอ่านแบบยาว (เช่น มากกว่า 10,000 bp) PBHoney พิจารณาความไม่ลงรอยกันของการอ่านภายในและส่วนท้ายแบบอ่อนของการอ่านแบบยาวเพื่อระบุรูปแบบโครงสร้าง
คุณสมบัติ
- การประกอบจีโนม
- การอัพเกรดจีโนม
- การเปลี่ยนแปลงโครงสร้าง
- การประเมินการประกอบ
ผู้ชม
วิทยาศาสตร์/การวิจัย
ภาษาโปรแกรม
หลาม
หมวดหมู่
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/pb-jelly/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา