นี่คือแอป Linux ชื่อ PPSeq: Parallel NGS Analysis เพื่อทำงานใน Linux ออนไลน์ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรุ่นล่าสุดได้เป็น ppseq-1.3-Linux-x86_64-pthread.gz สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ออนไลน์ชื่อ PPSeq: Parallel NGS Analysis เพื่อเรียกใช้ใน Linux ออนไลน์ด้วย OnWorks ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OnWorks Linux หรือ Windows ออนไลน์ หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ MACOS จากเว็บไซต์นี้
- 5. จาก OnWorks Linux OS คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่น ติดตั้ง และเรียกใช้
ภาพหน้าจอ
Ad
PPSeq: การวิเคราะห์ NGS แบบคู่ขนานเพื่อทำงานใน Linux ออนไลน์
DESCRIPTION
เทคโนโลยีการหาลำดับขั้นต่อไป (NGS) ที่มีปริมาณงานสูงได้กลายเป็นเครื่องมือที่มีประสิทธิภาพในหลาย ๆ ด้านของการวิจัยทางชีวการแพทย์ อย่างไรก็ตาม นอกจากการพัฒนาอย่างรวดเร็วแล้ว ขนาดข้อมูลและความซับซ้อนในการวิเคราะห์สำหรับ NGS ยังเกินความสามารถและความสามารถของอุปกรณ์ประมวลผลขนาดเล็กแบบดั้งเดิม เช่น อัลกอริธึมมัลติเธรดบนเวิร์กสเตชันแบบสแตนด์อโลน เพื่อแก้ไขปัญหานี้ ในที่นี้เราขอนำเสนอวิธีแก้ปัญหาโดยใช้ระบบการประมวลผลแบบขนานขนาดใหญ่ (MPP) ที่เพิ่มมากขึ้นเรื่อยๆคุณสมบัติ
- ppalgn - การจัดลำดับการอ่านตามลำดับการอ้างอิงแบบยาว
- ppbwt - สร้างดัชนี FM จากชุดลำดับดีเอ็นเอ
ผู้ชม
การศึกษา, วิศวกรรม, อุตสาหกรรมการดูแลสุขภาพ, เทคโนโลยีสารสนเทศ, องค์กรไม่แสวงหากำไร, วิทยาศาสตร์/การวิจัย
ส่วนติดต่อผู้ใช้
บรรทัดคำสั่ง
ภาษาโปรแกรม
C + +
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/ppseq/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา
