āļāļĩāđāļāļ·āļāđāļāļ Windows āļāļĩāđāļāļ·āđāļāļ§āđāļē High-Throughput Tabular Data Processor āđāļāļ·āđāļāļāļģāļāļēāļāđāļ Windows āļāļāļāđāļĨāļāđāļāđāļēāļ Linux āļāļāļāđāļĨāļāđ āļāļķāđāļāļŠāļēāļĄāļēāļĢāļāļāļēāļ§āļāđāđāļŦāļĨāļāļĢāļļāđāļāļĨāđāļēāļŠāļļāļāđāļāđāđāļāđāļ HTDP.tar.gz āļŠāļēāļĄāļēāļĢāļāđāļĢāļĩāļĒāļāđāļāđāļāļāļāđāļĨāļāđāđāļ OnWorks āļāļđāđāđāļŦāđāļāļĢāļīāļāļēāļĢāđāļŪāļŠāļāđāļāļĢāļĩāļŠāļģāļŦāļĢāļąāļāđāļ§āļīāļĢāđāļāļŠāđāļāļāļąāļ
āļāļēāļ§āļāđāđāļŦāļĨāļāđāļĨāļ°āđāļĢāļĩāļĒāļāđāļāđāđāļāļāļāļĩāđāļāļēāļāļāļāļāđāļĨāļāđāļāļĩāđāļāļ·āđāļāļ§āđāļē High-Throughput Tabular Data Processor āđāļāļ·āđāļāļāļģāļāļēāļāđāļ Windows āļāļāļāđāļĨāļāđāļāđāļēāļ Linux āļāļāļāđāļĨāļāđāļāđāļ§āļĒ OnWorks āļāļĢāļĩ
āļāļģāļāļēāļĄāļāļģāđāļāļ°āļāļģāđāļŦāļĨāđāļēāļāļĩāđāđāļāļ·āđāļāđāļĢāļĩāļĒāļāđāļāđāđāļāļāļāļĩāđ:
- 1. āļāļēāļ§āļāđāđāļŦāļĨāļāđāļāļāļāļĨāļīāđāļāļāļąāđāļāļāļĩāđāđāļāļāļĩāļāļĩāļāļāļāļāļļāļ
- 2. āđāļāđāļēāđāļāļāļĩāđ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX āļāđāļ§āļĒāļāļ·āđāļāļāļđāđāđāļāđāļāļĩāđāļāļļāļāļāđāļāļāļāļēāļĢ
- 3. āļāļąāļāđāļŦāļĨāļāđāļāļāļāļĨāļīāđāļāļāļąāļāļāļĩāđāđāļāļāļąāļ§āļāļąāļāļāļēāļĢāđāļāļĨāđāļāļąāļāļāļĨāđāļēāļ§
- 4. āđāļĢāļīāđāļĄāđāļāļĢāđāļāļĢāļĄāļāļģāļĨāļāļāļāļāļāđāļĨāļāđāļāļāļ OS OnWorks āļāļēāļāđāļ§āđāļāđāļāļāđāļāļĩāđ āđāļāđāđāļāļĢāđāļāļĢāļĄāļāļģāļĨāļāļāļāļāļāđāļĨāļāđāļāļāļ Windows āļāļĩāđāļāļĩāļāļ§āđāļē
- 5. āļāļēāļāļĢāļ°āļāļāļāļāļīāļāļąāļāļīāļāļēāļĢ Windows āļāļāļ OnWorks āļāļĩāđāļāļļāļāđāļāļīāđāļāđāļĢāļīāđāļĄāļāđāļ āđāļāļāļĩāđāļāļąāļ§āļāļąāļāļāļēāļĢāđāļāļĨāđāļāļāļāđāļĢāļē https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX āļāļĢāđāļāļĄāļāļ·āđāļāļāļđāđāđāļāđāļāļĩāđāļāļļāļāļāđāļāļāļāļēāļĢ
- 6. āļāļēāļ§āļāđāđāļŦāļĨāļāđāļāļāļāļĨāļīāđāļāļāļąāđāļāđāļĨāļ°āļāļīāļāļāļąāđāļ
- 7. āļāļēāļ§āļāđāđāļŦāļĨāļāđāļ§āļāđāļāļēāļāļāļĩāđāđāļāđāļāļāļāļāļāđāđāļ§āļĢāđāļĨāļĩāļāļļāļāļāđāļāļīāļŠāļāļĢāļīāļāļīāļ§āļāļąāļāļāļāļāļāļļāļ āđāļĄāļ·āđāļāļāļīāļāļāļąāđāļāđāļĨāđāļ§ āļāļļāļāļŠāļēāļĄāļēāļĢāļāļāļąāļāđāļāļīāļĨāļāļĨāļīāļāļāļĩāđāđāļāļāđāļāļ·āđāļāđāļĢāļĩāļĒāļāđāļāđāđāļāļāļāđāļ§āļĒ Wine āļāļļāļāļĒāļąāļāļŠāļēāļĄāļēāļĢāļāļĨāļāļāđāļāđ PlayOnLinux āļāļķāđāļāđāļāđāļāļāļīāļāđāļāļāļĢāđāđāļāļāđāļāļāļāļĩāļāļ Wine āļāļĩāđāļāļ°āļāđāļ§āļĒāļāļļāļāļāļīāļāļāļąāđāļāđāļāļĢāđāļāļĢāļĄāđāļĨāļ°āđāļāļĄāļĒāļāļāļāļīāļĒāļĄāļāļāļ Windows
āđāļ§āļāđāđāļāđāļāļ§āļīāļāļĩāđāļĢāļĩāļĒāļāđāļāđāļāļāļāļāđāđāļ§āļĢāđ Windows āļāļ Linux āđāļāđāđāļĄāđāļāļģāđāļāđāļāļāđāļāļāđāļāđ Windows Wine āđāļāđāļāđāļĨāđāļĒāļāļĢāđāļāļ§āļēāļĄāđāļāđāļēāļāļąāļāđāļāđāļāļāļ Windows āđāļāļāđāļāđāļāđāļāļāļāļĢāđāļŠāļāļĩāđāļŠāļēāļĄāļēāļĢāļāđāļĢāļĩāļĒāļāđāļāđāđāļāļĢāđāļāļĢāļĄ Windows āđāļāđāđāļāļĒāļāļĢāļāļāļāđāļāļŠāļāđāļāđāļāļ Linux āđāļāļĒāļāļ·āđāļāļāļēāļāđāļĨāđāļ§ Wine āļāļĒāļēāļĒāļēāļĄāļāļģ Windows āļāļĨāļąāļāļĄāļēāđāļāđāđāļŦāļĄāđāđāļŦāđāđāļāļĩāļĒāļāļāļāļāļąāđāļāđāļāđāđāļĢāļīāđāļĄāļāđāļ āđāļāļ·āđāļāđāļŦāđāļŠāļēāļĄāļēāļĢāļāđāļĢāļĩāļĒāļāđāļāđāđāļāļāļāļĨāļīāđāļāļāļąāļ Windows āđāļŦāļĨāđāļēāļāļąāđāļāļāļąāđāļāļŦāļĄāļāđāļāļĒāđāļĄāđāļāļģāđāļāđāļāļāđāļāļāđāļāđ Windows āļāļĢāļīāļāđ
āļ āļēāļāļŦāļāđāļēāļāļ
Ad
āļāļąāļ§āļāļĢāļ°āļĄāļ§āļĨāļāļĨāļāđāļāļĄāļđāļĨāđāļāļāļāļēāļĢāļēāļāļāļĢāļīāļĄāļēāļāļāļēāļāļŠāļđāļāđāļāļ·āđāļāļāļģāļāļēāļāđāļ Windows āļāļāļāđāļĨāļāđāļāđāļēāļ Linux āļāļāļāđāļĨāļāđ
DESCRIPTION
HIGH-THROUGHPUT TABULAR DATA PROCESSOR (HTDP) āđāļāđāļāđāļāļāļāļĨāļīāđāļāļāļąāļ Java āļāļĩāđāļĄāļĩāļāļļāļāļāļĢāļ°āļŠāļāļāđāđāļāļ·āđāļāļāļģāļāļ§āļĒāļāļ§āļēāļĄāļŠāļ°āļāļ§āļāđāļāļāļēāļĢāļŠāļģāļĢāļ§āļāļāđāļāļĄāļđāļĨāđāļĨāļ°āļĨāļāļāļēāļāđāļāđāļāļĨāđāļāđāļāļāļ§āļēāļĄāļāļāļēāļāđāļŦāļāđāļāļĩāđāđāļāļīāļāļāļēāļāđāļāļāđāļāđāļĨāļĒāļĩāļāļĢāļīāļĄāļēāļāļāļēāļāļŠāļđāļ āđāļāđāļ āļāļēāļĢāļāļąāļāļĨāļģāļāļąāļāļāļđāđāļāļāļēāļāļŦāļĢāļ·āļāđāļĄāđāļāļĢāļāļēāļĢāđāđāļĢāļĒāđāļāļģāļāļ§āļāļĄāļēāļ āļāļāļāļāđāđāļ§āļĢāđāđāļāđāļĢāļąāļāļāļēāļĢāļāļĢāļąāļāđāļŦāđāđāļŦāļĄāļēāļ°āļŠāļĄāļŠāļģāļŦāļĢāļąāļāļāđāļāļĄāļđāļĨ microarray āđāļĨāļ°āļāđāļāļĄāļđāļĨāļāļēāļĢāļāļąāļāļĨāļģāļāļąāļāļāļđāđāļāļāļēāļāļĨāļķāļ āļāļĒāđāļēāļāđāļĢāļāđāļāļēāļĄ āļŠāļēāļĄāļēāļĢāļāļĒāļāļĄāļĢāļąāļāļāļļāļāļāđāļāļĄāļđāļĨāļāļēāļĢāļēāļāđāļāļāļāļēāļĢāļēāļāļāļĩāđāļāļąāđāļāļāđāļ§āļĒāļāļąāļāļāļĢāļ°āđāļāđ āļāđāđāļāđ HTDP āļĒāļąāļāļŠāļēāļĄāļēāļĢāļāļāļģāđāļāđāļē āļāļĢāļ°āļĄāļ§āļĨāļāļĨ āđāļĨāļ°āđāļāļĨāļāđāļāļĨāđ Variant Call Format (VCF) āđāļ§āļāļĢāđāļāļąāļ 4.0, 4.1 āđāļĨāļ° 4.2 (http://samtools.github.io/hts-specs/VCFv4.2.pdf).HTDP āļĄāļĩāļāļąāļāļāđāļāļąāļāļāļēāļĢāļāļĢāļāļāļāļĩāđāļĢāļ§āļāđāļĢāđāļ§ āđāļĨāļ°āļŠāļēāļĄāļēāļĢāļāļāļĢāļ°āļĄāļ§āļĨāļāļĨāļāđāļāļĄāļđāļĨāļāļĩāđāļāļĢāļ°āļāļāļāļāđāļ§āļĒāđāļāļĨāđāļāļīāļāļāļļāļāđāļāļĩāđāļĒāļ§āļŦāļĢāļ·āļāļŦāļĨāļēāļĒāđāļāļĨāđ
āļāļēāļĢāļāđāļēāļāļāļīāļ: Madanecki P, BaÅut M, Buckley PG, Ochocka JR, Bartoszewski R, Crossman DK, et al. (2018) High-Throughput Tabular Data Processor â āđāļāļĨāļāļāļāļĢāđāļĄāđāļāļĢāļ·āđāļāļāļĄāļ·āļāļāļĢāļēāļāļīāļāļāļīāļŠāļĢāļ°āļŠāļģāļŦāļĢāļąāļāļāļēāļĢāļāļĢāļ°āļĄāļ§āļĨāļāļĨāļāļļāļāļāđāļāļĄāļđāļĨāļāļāļēāļāđāļŦāļāđ PLOS ONE 13(2): e0192858. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0192858
āļāļļāļāļŠāļĄāļāļąāļāļī
- āđāļāđāļāļēāļāđāļāđāļāļąāļāļāđāļāļĄāļđāļĨāļāļāļĨāļąāļĄāļāđāļāļĩāđāļāļąāđāļāļāđāļ§āļĒāļāļąāļāļāļĢāļ°āđāļāđ (āđāļāđāļ BED, GFF, GTF, WIG, VCF)
- āļĢāļ§āļĄāđāļāļĨāđāļāđāļāļĄāļđāļĨāđāļāļāļāļēāļĢāļēāļāđāļāđāļāļ§āļāļąāđāļāđāļĨāļ°āđāļāļ§āļāļāļ
- āļĢāļ§āļĄāđāļāļĨāđāļāđāļāļĄāļđāļĨāđāļāļāļāļēāļĢāļēāļāđāļāļĒāđāļāđāļāļģāđāļŦāļāđāļāļāļĩāđāļāļĄāļŦāļĢāļ·āļāļāļāļĨāļąāļĄāļāđāļāļąāđāļ§āđāļ
- āļāļ§āļēāļĄāļŠāļēāļĄāļēāļĢāļāđāļāļāļēāļĢāļāļĢāļāļāđāļĨāļ°āļāļēāļĢāļĨāļāļāđāļāļĄāļđāļĨāđāļĄāđāļāļģāļāļąāļ
- āđāļāļĨāđāļāđāļēāļ āđ āļāļĩāđāđāļāļĩāđāļĒāļ§āļāļąāļāļĢāļđāļāđāļāļāđāļĨāļ°āđāļāļ·āđāļāļŦāļēāļŠāļēāļĄāļēāļĢāļāļ§āļīāđāļāļĢāļēāļ°āļŦāđāđāļāđāđāļāđāļ§āļĨāļēāđāļāļĩāļĒāļ§āļāļąāļ
āļ āļēāļĐāļēāđāļāļĢāđāļāļĢāļĄ
āļāļ§āļē
āļāļĩāđāļāļ·āļāđāļāļāļāļĨāļīāđāļāļāļąāļāļāļĩāđāļŠāļēāļĄāļēāļĢāļāļāļķāļāļāđāļāļĄāļđāļĨāļāļēāļ https://sourceforge.net/projects/htdp/ āļĄāļĩāļāļēāļĢāđāļŪāļŠāļāđāđāļ OnWorks āđāļāļ·āđāļāđāļŦāđāļāļģāļāļēāļāļāļāļāđāļĨāļāđāđāļāļ§āļīāļāļĩāļāļĩāđāļāđāļēāļĒāļāļĩāđāļŠāļļāļāļāļēāļāļŦāļāļķāđāļāđāļāļĢāļ°āļāļāļāļāļīāļāļąāļāļīāļāļēāļĢāļāļĢāļĩāļāļāļāđāļĢāļē
