นี่คือแอป Windows ชื่อ Universal-mer ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรุ่นล่าสุดได้เป็น Universal-MerV1.0.0.zip สามารถทำงานออนไลน์ได้ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสติ้งฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและรันแอปออนไลน์ชื่อ Universal-mer พร้อม OnWorks ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OS OnWorks จากเว็บไซต์นี้ แต่โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows ที่ดีกว่า
- 5. จากระบบปฏิบัติการ Windows ของ OnWorks ที่คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นและติดตั้ง
- 7. ดาวน์โหลดไวน์จากที่เก็บซอฟต์แวร์ลีนุกซ์ดิสทริบิวชันของคุณ เมื่อติดตั้งแล้ว คุณสามารถดับเบิลคลิกที่แอปเพื่อเรียกใช้แอปด้วย Wine คุณยังสามารถลองใช้ PlayOnLinux ซึ่งเป็นอินเทอร์เฟซแฟนซีบน Wine ที่จะช่วยคุณติดตั้งโปรแกรมและเกมยอดนิยมของ Windows
ไวน์เป็นวิธีเรียกใช้ซอฟต์แวร์ Windows บน Linux แต่ไม่จำเป็นต้องใช้ Windows Wine เป็นเลเยอร์ความเข้ากันได้ของ Windows แบบโอเพ่นซอร์สที่สามารถเรียกใช้โปรแกรม Windows ได้โดยตรงบนเดสก์ท็อป Linux โดยพื้นฐานแล้ว Wine พยายามนำ Windows กลับมาใช้ใหม่ให้เพียงพอตั้งแต่เริ่มต้น เพื่อให้สามารถเรียกใช้แอปพลิเคชัน Windows เหล่านั้นทั้งหมดโดยไม่จำเป็นต้องใช้ Windows จริงๆ
ภาพหน้าจอ
Ad
สากล-mer
DESCRIPTION
Universal-Mer เป็นเครื่องมือนับ k-mer สำหรับขนาด k ทั้งหมดที่เป็นไปได้ในคราวเดียว มากกว่าเครื่องมือนับ k-mer ทั่วไป โปรแกรมสามารถสรุปผลการนับที่แน่นอนของ 1-mers ถึง l-mers ได้ในคราวเดียว โดยที่ l = ความยาวของสตริงย่อยที่ยาวที่สุดในลำดับอินพุต ซึ่งขณะนี้ความยาวสูงสุดตั้งไว้ที่ 100000- เมอร์ส โปรแกรมสามารถรายงานจำนวนการทำซ้ำทั้งหมด (ความถี่>1) และค่าเฉพาะ (ความถี่ = 1) mers และจำนวนสตริงย่อยที่เป็นไปได้ทั้งหมดโดยไม่ต้องตัด mers ความถี่ต่ำใด ๆ ออก
ไฟล์อินพุตอาจเป็นรูปแบบข้อความหรือฟาสต้า ตัวอักษรที่ป้อนตอนนี้มีเพียง {A, C, G, T} ไฟล์ข้อความอินพุตจะเกี่ยวข้องกับรูปแบบ fasta โดยไม่มีบรรทัดรายละเอียด หลังจากการนับและสร้างฐานข้อมูลความยาวที่เป็นไปได้ทั้งหมด k ของ k-mer เสร็จสมบูรณ์แล้ว ผู้ใช้สามารถเลือกขนาด k ในเมนูใดก็ได้เพื่อนับฮิสโตแกรม ดัมพ์ k-mers ค้นหาสตริงย่อย และสรุป k ที่เป็นไปได้ทั้งหมด
คุณสมบัติ
- สรุป 1-mers ซ้ำและไม่ซ้ำกันที่ชัดเจนถึง l-mers โดยที่ l = ความยาวที่ยาวที่สุดของการทำซ้ำ
- นับฮิสโตแกรมของ k-mers โดยที่ 1<=k<= ความยาวของลำดับอินพุต
- นับฮิสโตแกรมของ canonical k-mers โดยที่ 1<=k<= ความยาวของลำดับอินพุต
- ดัมพ์ k-mers โดยที่ 1<=k<= ความยาวของลำดับอินพุต
- ดัมพ์ canonical k-mers โดยที่ 1<=k<= ความยาวของลำดับอินพุต
- ค้นหา k-mer ขนาดใด ๆ ของ k โดยที่ k<=200000 ในลำดับอินพุต
- ค้นหาสตริงย่อยที่ยาวที่สุดของลำดับอินพุตที่ซ้ำกัน
ส่วนติดต่อผู้ใช้
คอนโซล/เทอร์มินัล, Command-line
ภาษาโปรแกรม
C
หมวดหมู่
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจากhttps://sourceforge.net/projects/universal-mer/ มีการโฮสต์ไว้ใน OnWorks เพื่อใช้งานออนไลน์ด้วยวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา
