นี่คือแอป Windows ชื่อ YeastpRofile เพื่อทำงานใน Windows แบบออนไลน์ผ่าน Linux ออนไลน์ ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรุ่นล่าสุดได้ในชื่อ YeastpRofile_V.2.zip สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้แบบออนไลน์ที่ชื่อว่า YeastpRofile เพื่อทำงานใน Windows ออนไลน์ผ่าน Linux ออนไลน์ด้วย OnWorks ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OS OnWorks จากเว็บไซต์นี้ แต่โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows ที่ดีกว่า
- 5. จากระบบปฏิบัติการ Windows ของ OnWorks ที่คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นและติดตั้ง
- 7. ดาวน์โหลดไวน์จากที่เก็บซอฟต์แวร์ลีนุกซ์ดิสทริบิวชันของคุณ เมื่อติดตั้งแล้ว คุณสามารถดับเบิลคลิกที่แอปเพื่อเรียกใช้แอปด้วย Wine คุณยังสามารถลองใช้ PlayOnLinux ซึ่งเป็นอินเทอร์เฟซแฟนซีบน Wine ที่จะช่วยคุณติดตั้งโปรแกรมและเกมยอดนิยมของ Windows
ไวน์เป็นวิธีเรียกใช้ซอฟต์แวร์ Windows บน Linux แต่ไม่จำเป็นต้องใช้ Windows Wine เป็นเลเยอร์ความเข้ากันได้ของ Windows แบบโอเพ่นซอร์สที่สามารถเรียกใช้โปรแกรม Windows ได้โดยตรงบนเดสก์ท็อป Linux โดยพื้นฐานแล้ว Wine พยายามนำ Windows กลับมาใช้ใหม่ให้เพียงพอตั้งแต่เริ่มต้น เพื่อให้สามารถเรียกใช้แอปพลิเคชัน Windows เหล่านั้นทั้งหมดโดยไม่จำเป็นต้องใช้ Windows จริงๆ
ภาพหน้าจอ:
YeastpRofile เพื่อทำงานใน Windows ออนไลน์ผ่าน Linux ออนไลน์
รายละเอียด:
YeastpRofile เป็นแอปพลิเคชันแบบฟอร์ม Windows แบบพกพาที่เขียนด้วยภาษา C# เพื่อคำนวณโปรไฟล์ของตัวแปรจีโนมรอบ ๆ ไซต์เริ่มต้นการถอดรหัส (TSS) และจุดสิ้นสุด (TTS) ของ mRNA ของยีสต์ โปรไฟล์ได้มาจากการคำนวณค่าสัมประสิทธิ์สหสัมพันธ์เพียร์สันทั่วทั้งจีโนม (R) ระหว่างค่าตัวแปรจีโนมและการนับ TSS (หรือ TTS) ที่การขยับที่เพิ่มขึ้นของเกลียวที่ถอดเสียงแล้ว ข้อมูลของการนับ TSS และ TTS ที่ใช้ในการคำนวณโปรไฟล์นั้นนำมาจากงานของ Pelechano et al (1). ไฟล์อินพุตต้องเป็นไฟล์รูปแบบ BedGraph โดยยึดตามลำดับจีโนมของยีสต์ที่ปล่อย R64 ไฟล์ที่ส่งออกคือตารางที่คั่นด้วยแท็บข้อความซึ่งรายงานค่า R สำหรับการเลื่อนต่างๆ ของพิกัดตัวแปรที่สัมพันธ์กับ TSS หรือ TTS R ที่เกี่ยวข้องกับแต่ละสาระยังถูกรายงานเพื่อตรวจสอบว่าได้โปรไฟล์ที่คล้ายกันในสองทิศทางของการถอดความ1) V. Pelechano, W. Wei, LM Steinmetz, ความหลากหลายในการถอดรหัสที่กว้างขวางซึ่งเปิดเผยโดยการทำโปรไฟล์ไอโซฟอร์ม, Nature, 497 (2013) 127-13
ผู้ชม
วิทยาศาสตร์/การวิจัย
ภาษาโปรแกรม
C#
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/yeastprofile/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา