Ito ang command na altree-add-Sp na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator
PROGRAMA:
NAME
altree-add-S - Pamagat...
SINOPSIS
altree-add-S [mga opsyon]
Pagpipilian:
--bersyon na bersyon ng programa
--short-help|h maikling mensahe ng tulong
--help help message na may mga paglalarawan ng mga opsyon
--man buong dokumentasyon
--first-input-file|i input file 1
--second-input-file|j input file 2 data tungkol sa katangian (kwalitibo o dami)
--output-file|o output file
--epsilon|e epsilon na halaga
--data-type|t uri ng data: SNP o DNA
--proportion|p proporsyon ng mga kaso sa sample (para sa qualitative data lang)
--data-qual|q uri ng data: qualitative o quantitative
[--outgroup|g] pangalan ng outgroup
--low|l kung ang isang haplotype ay katumbas o mas mababa sa -l beses, ang estado ng S ay itatakda sa "?"
Opsyon
--bersyon
I-print ang bersyon ng programa at paglabas.
--maikling-tulong
Mag-print ng maikling mensahe ng tulong at paglabas.
- Tumulong Mag-print ng mensahe ng tulong na may mga paglalarawan at paglabas ng mga opsyon.
--lalaki Ini-print ang manu-manong pahina at lalabas.
--first-input-file|i
Input file 1 (paup o phylip file)
--second-input-file|j
Ang input file 2, ay naglalaman ng bilang ng beses na ang isang ibinigay na haplotype ay dinadala ng case
at kontrolin ang mga indibidwal (data ng husay) o ang mga halaga ng dami
tumutugma sa isang naibigay na haplotype (quantitative data)
--output-file|o
Output file
--epsilon|e
parameter ng espilon (tingnan ang formula sa dokumentasyon)
--type-data|t
Uri ng data: DNA (ATGCU) o SNP (0-1)
--proporsyon|p
Proporsyon ng mga indibidwal na kaso sa sample
--outgroup|g
Pangalan ng outgroup (kung wala ito sa file na naglalaman ng bilang ng mga kaso at
mga kontrol sa bawat haplotype)
--data-qual|q
Tukuyin kung qualitative o quantitative ang data
--mababa|l kung ang isang haplotype ay nasa katumbas o mas mababa sa -l beses, ang estado ng S ay itatakda
sa "?"
DESCRIPTION
ito programa nagdaragdag ng bagong karakter (tinatawag na "character S") sa bawat haplotype sa input
file ayon sa bilang ng mga kaso at mga kontrol na nagdadala nito.
Gumamit ng altree-add-Sp online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net
