Ito ang command asn2ff na maaaring patakbuhin sa OnWorks free hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator
PROGRAMA:
NAME
asn2ff - i-convert ang ASN.1 biological data sa isang flat format (lumang bersyon)
SINOPSIS
asn2ff [-] [-A X] [-B X] [-C] [-G] [-L F] [-M] [-R] [-V F] [-a filename] [-b] [-d] [-e]
[-f b/p/e/s/x/z] [-g] [-h F] [-k F] [-l filename] [-m r/d/s/c/k/l/e/p] [-n F]
[-o filename] [-p F] [-q] [-r filename] [-s] [-t] [-v F] [-w] [-y] [-z]
DESCRIPTION
asn2ff kino-convert ang mga paglalarawan ng mga biological sequence mula sa NCBI's ASN.1 format sa isa sa
ilang mga flat-file na format. Ang program na ito ay binuo sa paligid ng isang hindi na ginagamit na interface; pakiusap
gamitin asn2gb(1) sa halip.
Opsyon
Ang isang buod ng mga opsyon ay kasama sa ibaba.
- I-print ang mensahe ng paggamit
-A X Ipakita ang rehiyon simula sa X (default ay 0)
-B X Ipakita ang rehiyon na nagtatapos sa X (default ang huling posisyon)
-C Ipakita ang mga komento ni Bankit
-G Ang output ay isang nangungunang bioseq lamang sa genome view
-L F Gumamit ng lumang (pre-Genbank 127.0) LOCUS line format
-M Ang output ay mapa bioseqs lamang
-R Para sa GenBank Release
-V F Huwag gumamit ng VERSION
-a filename
Filename para sa ASN.1 input (default ay stdin)
-b Ipasok ang asnfile sa binary mode
-d Gumamit ng SeqMgr indexing
-e Ang input ay isang Seq-entry
-f b/p/e/s/x/z
Format ng Output:
b GenBank (default)
p GenPept
e EMBL
s PseudoEMBL
x GenBankSelect
z EMBLPEPT
-g Ipakita ang mga numero ng gi
-h F Itago ang pagkakasunod-sunod
-k F Huwag gumamit ng mga kumplikadong set (phy-set,mut-set, pop-set)
-l filename
Mag-log ng mga error sa filename
-m r/d/s/c/k/l/e/p
Output mode:
r release (default)
d itapon
s Sequin
c Chromoscope
k dir-sub-debug
I dir-sub
e rebisahin
p bahagyang ulat
-n F Mahigpit na gene_binding
-o filename
Output Filename (default ay stdout)
-p F Alisin ang mga bagong tampok ng gene
-q Ang output ay isang nangungunang bioseq lamang
-r filename
Output error logfile (default ay stderr)
-s Ang input ay isang Seq-submit
-t Ipakita ang verbose message text
-v F Pigilan ang mga mensahe ng error
-w Gumamit ng HTML output format
-y I-print ang format ng tulong lamang
-z Bagong algorithm para sa mga orgname
Gamitin ang asn2ff online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net
