Ito ang command na bp_composite_LDp na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator
PROGRAMA:
NAME
bp_composite_LD -i filename.prettybase.txt --sortbyld > outfile
SINOPSIS
bp_composite_LD -i filename.prettybase [-o out.LD] [-f prettybase/csv] [--sortbyld] [--noconvertindels]
DESCRIPTION
Ito ay isang script na nagbibigay-daan sa isang madaling paraan upang makalkula ang composite LD.
Opsyon
-i o --sa filename
-f o --format na genotype na format (prettybase o CSV)
--sortbyld Upang makita ang data na pinagsunod-sunod ayon sa LD sa halip na lahat ng
site1/site2 pair LD values.
-o o --out output filename, kung hindi man ay ipi-print sa STDOUT
--noconvert (naaangkop para sa prettybase format na file lamang)
kung tinukoy ay HINDI tatangkaing i-convert ang indel
estado sa 'I' at tanggalin ang mga estado ('-') sa 'D'.
-h o --tulungan makita ang dokumentasyong ito
AUTHOR Jason Stajich, Mateo Titi
Para sa karagdagang impormasyon kumontak sa:
Matthew Hahn, Jason Stajich
Gamitin ang bp_composite_LDp online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net
