cmtk-interleaved_bad_slices - Online sa Cloud

PROGRAMA:

NAME

interleaved_bad_slices - Maghanap ng mga masasamang hiwa sa isang serye ng oras ng mga interleaved na larawan (hal, isang
resting-state fMRI series).

SINOPSIS

interleaved_bad_slices Mga ImagePath

DESCRIPTION

Ang tool na ito ay nagbabasa ng isang serye ng oras ng mga 3D na imahe at nakakakita ng mga outlier.

Opsyon

Global Toolkit Options (ito ay Nagbahagi by lahat CMTK kasangkapan)
- Tumulong
Sumulat ng listahan ng mga pangunahing opsyon sa command line sa karaniwang output.

--tulong-lahat
Sumulat ng kumpletong listahan ng basic at advanced na mga opsyon sa command line sa karaniwang output.

--wiki
Isulat ang listahan ng mga opsyon sa command line sa karaniwang output sa MediaWiki markup.

--lalaki
Isulat ang man page source sa 'nroff' markup sa karaniwang output.

--bersyon
Isulat ang bersyon ng toolkit sa karaniwang output.

--echo
Isulat ang kasalukuyang command line sa karaniwang output.

--verbose-level
Itakda ang antas ng verbosity.

--verbose, -v
Dagdagan ang antas ng verbosity ng 1 (hindi na ginagamit; suportado para sa backward compatibility).

--mga thread
Itakda ang maximum na bilang ng mga parallel na thread (para sa POSIX thread at OpenMP).

input Options
--slice-orientation
Tukuyin ang oryentasyon ng slice ng mga diffusion na imahe. Mga sinusuportahang halaga: "axial",
"sagittal", "coronal", "slice-x", "slice-y", "slice-z", kung saan ang default ay "axial",
o gumamit ng isa sa mga sumusunod:

--ehe
Mga hiwa ng axial [Ito is ang default]

--sagittal
Mga hiwa ng Sagittal

--coronal
Mga hiwa ng korona

--hiwa-x
Ang X coordinate axis ay direksyon ng slice

--hiwa-y
Ang Y coordinate axis ay direksyon ng slice

--hiwa-z
Ang Z coordinate axis ay direksyon ng slice [Ito is ang default]

Masama Hiwa Paniniktik
--sukatan
Sukat ng pagkakatulad ng larawan sa larawan upang ihambing ang mga kalapit na hiwa. Mga sinusuportahang halaga:
"ncc", "rms", kung saan ang default ay "ncc", o gumamit ng isa sa mga sumusunod:

--ncc
Normalized na cross correlation. [Ito is ang default]

--rms
Root ng mean squared differences.

--stdev-thresh
Threshold para sa masamang pagkakakilanlan ng slice sa mga unit ng intensity standard deviations tapos na
lahat ng kaukulang mga hiwa mula sa natitirang mga larawan ng pagsasabog. [Default: 3]

Pagbubuhos Options
--masamang-hiwa-giik
Minimum na bilang ng mga nakitang masasamang hiwa bago mag-ulat ng volume (bilang lamang ng
ang mga nakitang masasamang hiwa ay iniuulat sa kasong ito, sa halip na magkahiwalay ang bawat hiwa).
[Default: 0]

MGA AUTHORS

Torsten Rohlfing, na may mga kontribusyon mula kay Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff, at Yaroslav Halchenko

Gumamit ng cmtk-interleaved_bad_slices online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net