InglesPransesEspanyol

OnWorks favicon

convertPolishes - Online sa Cloud

Patakbuhin ang convertPolishes sa OnWorks na libreng hosting provider sa Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator

Ito ang command convertPolishes na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator

PROGRAMA:

NAME


sim4dbutils - mga utility upang gumana sa mga file ng pagkakahanay na binuo ng sim4db

convertPolishes - mag-convert sa pagitan ng sim4db at GFF3 na mga format
filterPolishes - filter alignment batay sa pagkakakilanlan ng pagkakasunud-sunod, saklaw at haba.
mergePolishes - pagsamahin ang mga alignment mula sa maraming file
sortPolishes - pag-uri-uriin ang mga alignment ayon sa cDNA o genomic sequence index o pangalan ng sequence
convertToExtent - I-convert mula sa sim4db na format sa isang solong linya na tab-delimited na format
fixPolishesIID - Nag-a-update ng sim4db file para magamit ang sequence index ng isang partikular na fasta file.
Magagamit din para mag-extract ng subset ng mga alignment mula sa sim4db file.
depthOfPolishes - Naglalabas ng tab-delimited histogram ng lalim ng polishes sa iba't ibang
mga laki ng bintana.
headPolishes - i-print ang unang N alignment sa isang file, katulad ng ulo(1)
pickBestPolish - iulat lamang ang 'pinakamahusay' na pagkakahanay para sa bawat cDNA
pickUniquePolish - nag-uulat ng mga alignment kung saan mayroong malinaw na solong pinakamahusay na pagkakahanay para sa
bawat cDNA.
plotCoverageVsIdentity - Bumubuo ng (1) histogram ng porsyentong pagkakakilanlan, (2) a
histogram ng porsyentong saklaw, at (3) isang listahan ng porsyentong pagkakakilanlan at saklaw (para sa
gamitin sa isang scatter plot).
uniqPolishes - Sinasala ang lahat ng alignment para sa cDNA na may maraming alignment (-uniq) o
na may isang solong pagkakahanay (-dupl). Kapareho ng kakaiba(1)
realignPolishes - muling kalkulahin ang mga alignment na nakalista sa isang sim4db file.
reportAlignmentDifferences - bumubuo ng histogram ng mga uri ng error sa isang set ng
mga pagkakahanay Hindi suportado at Deprecated
comparePolishes - Iugnay ang mga alignment sa dalawang file.
convertToAtac - Kino-convert mula sa sim4db format sa ATAC format.
detectChimera - Sinusuri ang mga alignment para sa mga sequence na maaaring chimeric.
mappedCoverage - Iniuulat ang dami ng sequence ng query (EST, cDNA) na sakop ng
mga pagkakahanay.
parseSNP - Sinusuri ang mga alignment para sa mga SNP.
removeDuplicate - hinahanap ang input para sa mga duplicate na alignment.
vennPolishes - Bumubuo ng Venn diagram para sa maramihang sim4db file. Ginamit sa loob by
ESTMapper malinis na mga Polish
summarizePolishes

DESCRIPTION


Ang mga programang ito ay isang hanay ng mga utility na magagamit sim4db(1)-generated alignment file.

Gamitin ang convertPolishes online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net


Mga Libreng Server at Workstation

Mag-download ng Windows at Linux apps

  • 1
    PostInstallerF
    PostInstallerF
    I-install ng PostInstallerF ang lahat ng
    software na Fedora Linux at iba pa
    ay hindi kasama bilang default, pagkatapos
    pagpapatakbo ng Fedora sa unang pagkakataon. Nito
    madali para sa...
    I-download ang PostInstallerF
  • 2
    bakas
    bakas
    Ang strace project ay inilipat sa
    https://strace.io. strace is a
    diagnostic, debugging at pagtuturo
    userspace tracer para sa Linux. Ito ay ginagamit
    para subaybayan ang isang...
    I-download ang strace
  • 3
    gMKVExtractGUI
    gMKVExtractGUI
    Isang GUI para sa mkvextract utility (bahagi ng
    MKVToolNix) na kinabibilangan ng karamihan (kung
    hindi lahat) pag-andar ng mkvextract at
    mkvinfo utility. Nakasulat sa C#NET 4.0,...
    I-download ang gMKVExtractGUI
  • 4
    JasperReports Library
    JasperReports Library
    Ang JasperReports Library ay ang
    pinakasikat na open source sa mundo
    katalinuhan sa negosyo at pag-uulat
    makina. Ito ay ganap na nakasulat sa Java
    at kaya nitong...
    I-download ang JasperReports Library
  • 5
    Mga Frappe Books
    Mga Frappe Books
    Ang Frappe Books ay isang libre at open source
    desktop book-keeping software na
    simple at mahusay na idinisenyo upang magamit ng
    maliliit na negosyo at mga freelancer. Ito'...
    I-download ang Frappe Books
  • 6
    Numerical Python
    Numerical Python
    BALITA: Ang NumPy 1.11.2 ang huling release
    na gagawin sa sourceforge. Mga gulong
    para sa Windows, Mac, at Linux pati na rin
    Ang mga naka-archive na pamamahagi ng pinagmulan ay maaaring maging...
    I-download ang Numerical Python
  • Marami pa »

Linux command

Ad