InglesPransesEspanyol

OnWorks favicon

gaeval - Online sa Cloud

Patakbuhin ang gaeval sa OnWorks na libreng hosting provider sa Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator

Ito ang command gaeval na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator

PROGRAMA:

NAME


gaeval - kalkulahin ang saklaw at mga marka ng intergrity para sa mga modelo ng gene batay sa transcript
mga pagkakahanay

SINOPSIS


gaeval [pagpipilian] alignments.gff3 genes.gff3 [moregenes.gff3 ...]

DESCRIPTION


Pangunahing mga pagpipilian:

-h|--tulong
i-print ang mensahe ng tulong na ito at lumabas

-v|--bersyon
i-print ang numero ng bersyon at lumabas

Mga timbang para sa pagkalkula ng marka ng integridad (dapat magdagdag ng hanggang 1.0):

-a|--alpha: DOBLE
kinumpirma ng mga intron, o % inaasahang haba ng CDS para sa mga single-exon na gene; ang default ay 0.6

-b|--beta: DOBLE
saklaw ng exon; ang default ay 0.3

-g|--gamma: DOBLE
% inaasahang 5' UTR ang haba; ang default ay 0.05

-e|--epsilon: DOBLE
% inaasahang 3' UTR ang haba; ang default ay 0.05

Mga inaasahang haba ng feature para sa pagkalkula ng marka ng integridad:

-c|--exp-cds: INT
inaasahang haba ng CDS (sa bp); ang default ay 400

-5|--exp-5putr: INT
inaasahang 5' UTR ang haba; ang default ay 200

-3|--exp-3putr: INT
inaasahang 3' UTR ang haba; ang default ay 100

Gamitin ang gaeval online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net


Mga Libreng Server at Workstation

Mag-download ng Windows at Linux apps

  • 1
    Toolbox para sa Java/JTOpen
    Toolbox para sa Java/JTOpen
    Ang IBM Toolbox para sa Java / JTOpen ay isang
    library ng mga klase ng Java na sumusuporta sa
    client/server at internet programming
    mga modelo sa isang system na tumatakbo sa OS/400,
    i5/OS, o...
    I-download ang Toolbox para sa Java/JTOpen
  • 2
    D3.js
    D3.js
    D3.js (o D3 para sa Data-Driven Documents)
    ay isang JavaScript library na nagbibigay-daan sa iyo
    upang makabuo ng dynamic, interactive na data
    visualization sa mga web browser. Sa D3
    ikaw...
    I-download ang D3.js
  • 3
    Shadowsocks
    Shadowsocks
    Isang mabilis na tunnel proxy na tumutulong sa iyo
    bypass firewalls Ito ay isang application
    na maaari ring kunin mula sa
    https://sourceforge.net/projects/shadowsocksgui/.
    Ito ha...
    I-download ang Shadowsocks
  • 4
    Mga Tema ng GLPI
    Mga Tema ng GLPI
    I-download ang release sa
    https://github.com/stdonato/glpi-modifications/
    Mga tema ng kulay para sa GLPI 0.84 at 0.85 Bago
    Mga Pagbabago para sa GLPI Ito ay isang
    application na c...
    I-download ang Mga Tema ng GLPI
  • 5
    SMPlayer
    SMPlayer
    Ang SMPlayer ay isang libreng media player para sa
    Windows at Linux na may mga built-in na codec
    na nakakapag-play din ng mga video sa YouTube. Isa
    sa mga pinakakawili-wiling tampok ng
    SMPlayer:...
    I-download ang SMPlayer
  • 6
    AAX hanggang MP3
    AAX hanggang MP3
    Paggamit: - I-install ang Audible Manager
    at magbukas ng file ng iyong account. - Tanda
    sa iyong naririnig na account (sa
    aplikasyon). Ngayon ay maaari na ang programa
    convert ka...
    I-download ang AAX sa MP3
  • Marami pa »

Linux command

Ad