Ito ang command na gmod_fasta2gff3.plp na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator
PROGRAMA:
NAME
$O - I-convert ang FASTA sa simpleng GFF3
SINOPSIS
% $O [mga opsyon]
COMMAND-LINE Opsyon
--fasta_dir Direktoryo ay naglalaman ng mga fasta file
(default: ./fasta)
--gfffilename Pangalan ng GFF3 file na gagawin
(default: ./out.gff)
--type SO type para italaga sa bawat feature
(default: EST)
--source Text na lalabas sa source column
(default: .)
--attributes Karagdagang tag=mga pares ng halaga na lalabas sa column 9
--nosequence Pigilan ang seksyong ##FASTA (ibig sabihin, huwag
print DNA sequence)
DESCRIPTION
Ang script na ito ay kumukuha lamang ng isang koleksyon ng mga fasta file at kino-convert ang mga ito sa simpleng GFF3
angkop para sa pag-load sa chado.
MGA AUTHORS
Scott Cain[protektado ng email]>
Copyright (c) 2006
Ang library na ito ay libreng software; maaari mo itong muling ipamahagi at/o baguhin ito sa ilalim nito
termino bilang Perl mismo.
Gamitin ang gmod_fasta2gff3.plp online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net
