Ito ang command na gt-compreads-refcompress na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator
PROGRAMA:
NAME
gt-compreads-refcompress - Bumubuo ng compact encoding para sa fastq data gamit ang Reference
Mga Compressed Reads (RCR).
SINOPSIS
gt nagkukumpara refcompress [pagpipilian ...] (-bam file -ref file)
DESCRIPTION
-v [oo|hindi]
maging verbose (default: hindi)
-mquals [oo|hindi]
kalidad ng pagmamapa ng tindahan para sa bawat nabasa (default: hindi)
-katulad [oo|hindi]
mag-imbak ng lahat ng mga halaga ng kalidad para sa bawat pagbabasa, ito ay nagpapahiwatig ng pagpapagana ng opsyon na "vquals"
(default: hindi)
-vquals [oo|hindi]
mag-imbak ng mga halaga ng kalidad ng mga nabasang posisyon na may mga pagkakaiba-iba kumpara sa reference
(default: hindi)
-descs [oo|hindi]
store read name para sa bawat read (default: no)
-ureads [oo|hindi]
mag-imbak ng mga hindi naka-map na nabasa sa isang hiwalay na fastq file (base name ang magiging value na ibinigay sa
magiging " _unmapped.fastq" ang pangalan at suffix (default: no)
-ref [pisi]
Index file (binuo ng gt encseq tool) para sa reference na genome. (default:
hindi natukoy)
-bam [pisi]
File na naglalaman ng alignment ng mga reads sa genome (pinagsunod-sunod na ".bam" file). (default:
hindi natukoy)
-yam [pisi]
tukuyin ang batayang pangalan para sa RCR na mabubuo. Kung hindi nakatakda, ang pangalan ng base ay itatakda sa base
pangalan ng value na ibinigay para sa opsyong "bam" (default: undefined)
-tulong
ipakita ang tulong at paglabas
-version
ipakita ang impormasyon ng bersyon at lumabas
Pag-uulat TUMBOK
Mag-ulat ng mga bug sa[protektado ng email]>.
Gumamit ng gt-compreads-refcompress online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net
