gt - Online sa Cloud

PROGRAMA:

NAME

gt - Ang GenomeTools genome analysis system.

SINOPSIS

gt [pagpipilian ...] [tool | script] [argumento ...]

DESCRIPTION

-i [oo|hindi]
ipasok ang interactive na mode pagkatapos i-execute kasangkapan or script

-q [oo|hindi]
pigilan ang mga babala

-pagsusulit [oo|hindi]
magsagawa ng mga unit test at lumabas

-binhi [halaga]
manu-manong itakda ang binhi para sa random number generator. 0 ay bumubuo ng isang binhi mula sa kasalukuyang oras
at id ng proseso

-tulong
ipakita ang tulong at paglabas

-version
ipakita ang impormasyon ng bersyon at lumabas

Tool:

· kama_sa_gff3

· cds

· chain2dim

· chseqids

· linisin

· nagkukumpara

· condenseq

· pagkapareho

· convertseq

· csa

· tuldok

· dupfeat

· encseq

· encseq2spm

· eval

· extractfeat

· extractseq

· fastq_sample

· featureindex

· bakas ng daliri

· genomediff

· gff3

· gff3_to_gtf

· gff3validator

· gtf_to_gff3

· lumukso

· id_to_md5

· inlineseq_add

· inlineseq_split

· makialam

· loccheck

· ltrclustering

· ltrdigest

· ltrharvest

· kasangkapan ng posporo

· matstat

· md5_to_id

· pagsamahin

· mergefeat

· mgth

· mkfeatureindex

· mkfmindex

· mmapandread

· nag-order

· packedindex

· prebwt

· readjoiner

· muling mahanap

· scriptfilter

· seed_extend

· piliin

· seq

· seqfilter

· seqids

· seqmutate

· seqorder

· seqstat

· seqtransform

· seqtranslate

· sequniq

· shredder

· shulengthdist

· simreads

· gumuhit ng plano

· sketch_page

· snpper

· maliit na butil

· splicesiteinfo

· splitfasta

· stat

· panlapi

· tagerator

· tallymer

· nakakapagod

· kakaiba

· uniquesub

· wtree

Itakda ang environment variable GT_MEM_BOOKKEEPING=on upang paganahin ang memory bookkeeping (hal.,
tulad nito: env GT_MEM_BOOKKEEPING=sa gt).

Itakda ang environment variable GT_ENV_OPTIONS=-spacepeak upang magpakita ng spacepeak pagkatapos ng programa
tumakbo. Itakda ang environment variable GT_ENV_OPTIONS=-showtime para ipakita ang mga oras ng pagproseso
ilang bahagi ng programa kung ipinatupad.

Itakda ang environment variable na GT_SEED sa isang integer value para magbigay ng seed para sa random
generator ng numero. Maaaring ma-override ng -seed na opsyon.

Posible ang mga kumbinasyon. Ang pagpapatakbo ng gt binary na may GT_ENV_OPTIONS=-help ay nagpapakita ng lahat
posibleng "mga opsyon sa kapaligiran".

Pag-uulat TUMBOK

Mag-ulat ng mga bug sa[protektado ng email]>.

Gamitin ang gt online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net