Ito ang command infoseqe na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator
PROGRAMA:
NAME
infoseq - Ipakita ang pangunahing impormasyon tungkol sa mga sequence
SINOPSIS
infoseq -pagkakasunod-sunod seqall -mga hanay boolean -delimiter pisi [-outfile outfile]
[-html boolean] -isa lang boolean -heading boolean -usa boolean -database boolean
-yam boolean - pag-akyat boolean -gi boolean -seqversion boolean -Uri boolean
-haba boolean -pgc boolean -organismo boolean - paglalarawan boolean
infoseq -tulong
DESCRIPTION
infoseq ay isang command line program mula sa EMBOSS (“ang European Molecular Biology Open
Software Suite”). Bahagi ito ng (mga) command group na "Pagbawi ng data:Data ng sequence."
Opsyon
input seksyon
-pagkakasunod-sunod seqall
Advanced seksyon
-mga hanay boolean
Itakda ang opsyong ito sa (Y) para i-print ang impormasyon ng pagkakasunud-sunod sa maayos at nakahanay na mga column
ang output file. Bilang kahalili, iwanan itong hindi nakatakda (N), kung saan ang impormasyon
ang mga talaan ay lilimitahan ng isang karakter, na maaari mong tukuyin sa pamamagitan ng paggamit ng
-pagpipilian sa delimiter. Sa madaling salita, kung naka-set ang -columns, ang pagpipiliang -delimiter ay
override. Default na halaga: Y
-delimiter pisi
Ang string na ito, na karaniwang isang solong character lamang, ay ginagamit upang limitahan ang indibidwal
mga tala sa text output file. Maaaring ito ay isang space character, isang tab na character, a
pipe character o anumang iba pang karakter o string. Default na halaga: |
Pagbubuhos seksyon
-outfile outfile
Kung ilalagay mo ang pangalan ng isang file dito, isusulat ng program na ito ang mga detalye ng pagkakasunud-sunod
sa file na iyon. Default na halaga: stdout
-html boolean
Default na halaga: N
-isa lang boolean
Ito ay isang paraan ng pagpapaikli ng command line kung gusto mo lamang ng ilang bagay
ipinapakita. Sa halip na tukuyin ang: '-nohead -noname -noacc -notype -nopgc -nodesc' sa
makuha lamang ang output ng haba, maaari mong tukuyin ang '-only -length' Default na halaga: N
-heading boolean
Default na halaga: Y
-usa boolean
Default na halaga: @(!$(only))
-database boolean
Default na halaga: @(!$(only))
-yam boolean
Default na halaga: @(!$(only))
- pag-akyat boolean
Default na halaga: @(!$(only))
-gi boolean
Default na halaga: N
-seqversion boolean
Default na halaga: N
-Uri boolean
Default na halaga: @(!$(only))
-haba boolean
Default na halaga: @(!$(only))
-pgc boolean
Default na halaga: @(!$(only))
-organismo boolean
Default na halaga: @(!$(only))
- paglalarawan boolean
Default na halaga: @(!$(only))
Gamitin ang infoseqe online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net