Ito ang command plotcone na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator
PROGRAMA:
NAME
plotcon - Pag-iingat ng plot ng pagkakahanay ng pagkakasunod-sunod
SINOPSIS
plotcon -mga pagkakasunod-sunod seqset [-scorefile matris] -winsize kabuuan -graph xygraph
plotcon -tulong
DESCRIPTION
plotcon ay isang command line program mula sa EMBOSS (“ang European Molecular Biology Open
Software Suite”). Ito ay bahagi ng "Alignment:Multiple" command group(s).
Opsyon
input seksyon
-mga pagkakasunod-sunod seqset
File na naglalaman ng pagkakahanay ng sequence
-scorefile matris
Ito ang scoring matrix file na ginagamit kapag naghahambing ng mga sequence. Bilang default ito ay ang
file na 'EBLOSUM62' (para sa mga protina) o ang file na 'EDNAFULL' (para sa mga nucleic sequence). Ang mga ito
Ang mga file ay matatagpuan sa direktoryo ng 'data' ng pag-install ng EMBOSS.
Kailangan seksyon
-winsize kabuuan
Ang bilang ng mga column hanggang sa average na kalidad ng alignment ay tapos na. Ang mas malaki ang halagang ito, ang
magiging smooth ang plot. Default na halaga: 4
Pagbubuhos seksyon
-graph xygraph
Gumamit ng plotcone online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net
