Ito ang command repeatviz.pl na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator
PROGRAMA:
NAME
repeatviz.pl -- tingnan ang isang grupo ng mga pag-uulit gamit ang graphviz
SINOPSIS
repeatviz.pl [output]
Opsyon
ang output ay tinukoy batay sa pangalan ng input maliban kung tinukoy
Pagpipilian:
--echo ay nagpapakita ng lahat ng input sa R (napaka-spam).
--colors={rainbow,heat,terrain,topo,cm,cool} ay gumagamit ng kahaliling color palette (default ay rainbow). Ang mga custom na palette ay maaari ding gawin sa pamamagitan ng pagbibigay ng listahan ng mga kulay (tulad ng pula, dilaw, asul).
--colorby={size,id,density} tukuyin kung ano ang pipiliin na mga kulay batay sa (default ay id)
--density={N} sample repeat density sa bawat N bp (default ay kinakalkula ang isang halaga batay sa lapad*res at laki ng genome)
--coloropts={mga karagdagang opsyon na ipapasa sa color generator ng R}
--kunekta gumuhit ng pagkonekta sa mga gilid para sa mga punto sa magkatabing pagkakasunud-sunod
--maxlines={N} huwag gumuhit ng mga linya upang ikonekta ang mga pares ng cluster-sequence na may higit sa N na mga gilid
--size={N} laki ng mga tuldok
--bigfirst plot malalaking cluster muna
--smallfirst plot maliliit na cluster muna (default)
--res={DPI} ay default sa 96
--width|height={N} laki ng graph sa pulgada
--legend={position} na posisyon upang maglagay ng alamat (R keywords tulad ng "right" o "topright" ay maganda)
--legendpts={N} bilang ng mga tuldok na ilalagay sa legend (default ay 8). dapat hindi bababa sa 2
--squeeze={[0,1)} Ang mga label ng Y axis ay hindi angkop sa frame? pisilin ang graph gamit ito.
--squeeze={[0,1),F} isang halaga upang baguhin ang tamang margin ay maaari ding tukuyin ng F tulad nito.
Gamitin ang repeatviz.pl online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net