Ito ang Linux app na pinangalanang ArtificialFastqGenerator na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang ArtificialFastqGenerator_19_05_2015.zip. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang ArtificialFastqGenerator na may OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
ArtificialFastqGenerator
Ad
DESCRIPTION
Kinukuha ng ArtificialFastqGenerator ang reference na genome (sa FASTA na format) bilang input at naglalabas ng mga artipisyal na FASTQ na file sa Sanger na format. Maaari itong tumanggap ng mga marka ng kalidad ng Phred base mula sa mga kasalukuyang FASTQ file, at gamitin ang mga ito upang gayahin ang mga error sa pagkakasunud-sunod. Dahil ang mga artipisyal na FASTQ ay nagmula sa reference genome, ang reference na genome ay nagbibigay ng gold-standard para sa mga variant ng pagtawag (Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) at insertions and deletion (indels)). Nagbibigay-daan ito sa pagsusuri ng isang pipeline ng pagsusuri sa Next Generation Sequencing (NGS) na nag-a-align ng mga reads sa reference genome at pagkatapos ay tumatawag sa mga variant.Audience
Industriya ng Pangangalagang Pangkalusugan, Agham/Pananaliksik, Mga Advanced na End User
Wika ng Programming
Java
Ito ay isang application na maaari ding makuha mula sa https://sourceforge.net/projects/artfastqgen/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.